RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 HMGN1P05114 100 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 SAGP10523 405 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 BMP7P18075 431 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 MAKP20794 623 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 RHBDD2Q6NTF9 364 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 HSDL2Q6YN16 418 aa22.07■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 ANKK1Q8NFD2 765 aa22.07■■□□□ 1.12
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RPUSD1-201ENST00000007264 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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RPUSD1-201ENST00000007264 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa22.07■■□□□ 1.12
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RPUSD1-201ENST00000007264 IGKV3-11P04433 115 aa22.06■■□□□ 1.12
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RPUSD1-201ENST00000007264 MED17Q9NVC6 651 aa22.06■■□□□ 1.12
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RPUSD1-201ENST00000007264 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa22.05■■□□□ 1.12
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RPUSD1-201ENST00000007264 ADAM11O75078 769 aa22.05■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 IL33O95760 270 aa22.05■■□□□ 1.12
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RPUSD1-201ENST00000007264 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa22.05■■□□□ 1.12
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RPUSD1-201ENST00000007264 FGF11Q92914 225 aa22.05■■□□□ 1.12
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RPUSD1-201ENST00000007264 MND1Q9BWT6 205 aa22.05■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 CTSFQ9UBX1 484 aa22.05■■□□□ 1.12
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RPUSD1-201ENST00000007264 OR52I1Q8NGK6 324 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 RNFT2Q96EX2 444 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC74BQ96LY2 380 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 CKMT1AP12532 417 aa22.03■■□□□ 1.12
RPUSD1-201ENST00000007264 MTNR1AP48039 350 aa22.03■■□□□ 1.12
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