RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640554.1

SDHD-209, Transcript of succinate dehydrogenase complex subunit D, human

TSL 5

Gene SDHD, Length 727 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SDHD-209	ENST00000640554	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	GTF2H4	Q92759	462 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	RAB8B	Q92930	207 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	SPDL1	Q96EA4	605 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	ARSG	Q96EG1	525 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	LAT2	Q9GZY6	243 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	MED17	Q9NVC6	651 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	MKLN1	Q9UL63	735 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554		A0A096LPI6	279 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	KIAA0513	O60268	411 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	UGT2B17	O75795	530 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	TOX	O94900	526 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	RCBTB2	O95199	551 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	CRH	P06850	196 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	UBL4A	P11441	157 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	COX6B1	P14854	86 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	CTSS	P25774	331 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	COL8A1	P27658	744 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	ELK4	P28324	431 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	CDKN2C	P42773	168 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	ZNF117	Q03924	483 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	FADD	Q13158	208 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	CBFB	Q13951	182 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	GPAT3	Q53EU6	434 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	ZNF614	Q8N883	585 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	VPS33A	Q96AX1	596 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	NPHS2	Q9NP85	383 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	VDAC3	Q9Y277	283 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	ZNF175	Q9Y473	711 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	GMEB1	Q9Y692	573 aa		12.88	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554		A0A1W2PP18	115 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	GJE1	A6NN92	205 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	CLCA1	A8K7I4	914 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	C17orf51	A8MQB3	221 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	DNAJA2	O60884	412 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	NUDT14	O95848	222 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	CSTA	P01040	98 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	LINGO3	P0C6S8	592 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	NR2F1	P10589	423 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	CDSN	Q15517	529 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	AGK	Q53H12	422 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	ACBD4	Q8NC06	268 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	GPR119	Q8TDV5	335 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	TMEM234	Q8WY98	164 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554		A0A0G2JND7	137 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554		H3BML4	177 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	CLIC1	O00299	241 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	SYT5	O00445	386 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	ADAMDEC1	O15204	470 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	H6PD	O95479	791 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	NPIPA8	P0DM63	369 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	FCGR2A	P12318	317 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	PGC	P20142	388 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	CRAT	P43155	626 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	SLC6A8	P48029	635 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	CRISP3	P54108	245 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	CASP9	P55211	416 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	KCNJ10	P78508	379 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	CHRNE	Q04844	493 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	TFF3	Q07654	80 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SDHD-209	ENST00000640554	FGFBP1	Q14512	234 aa		12.86	□□□□□ -0.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms