RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635392.1

SMARCA2-240, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, human

TSL 5

Gene SMARCA2, Length 291 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCA2-240	ENST00000635392	PFKFB2	O60825	505 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	CABYR	O75952	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	DEXI	O95424	95 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	IGSF6	O95976	241 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	CYBA	P13498	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	HTR2A	P28223	471 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	ETV5	P41161	510 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	RGS19	P49795	217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	GSK3B	P49841	420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	NAPA	P54920	295 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	PCK2	Q16822	640 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	LHX4	Q969G2	390 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	ERP44	Q9BS26	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	TPPP3	Q9BW30	176 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	RAB33B	Q9H082	229 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	WDR76	Q9H967	626 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	MLX	Q9UH92	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392		A0A0G2JMZ2	1700 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	MGAM	O43451	1857 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	RLF	Q13129	1914 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	TTC26	A0AVF1	554 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	LRIT2	A6NDA9	550 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	CYTH3	O43739	400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	SDC3	O75056	442 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	MBD3	O95983	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	GSTA1	P08263	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	HTR5A	P47898	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	CSRP3	P50461	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	SNAP25	P60880	206 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392		Q6ZTC4	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	C4orf36	Q96KX1	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	TSPY26P	Q9H489	355 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	GHRL	Q9UBU3	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392		A0A0J9YVX5	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392		A0A1W2PPR1	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	SMCO2	A6NFE2	343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392		K7ERI5	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	PDE5A	O76074	875 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	PCCB	P05166	539 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	THRB	P10828	461 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	TNNI3	P19429	210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	POU3F4	P49335	361 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	ACADVL	P49748	655 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	CNTN2	Q02246	1040 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	CD300C	Q08708	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	TFDP1	Q14186	410 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	NADK2	Q4G0N4	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	RNF130	Q86XS8	419 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	C18orf12	Q96KH6	178 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	VPS35	Q96QK1	796 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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