RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634931.1

SMARCA2-231, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, human

TSL 5 BASIC

Gene SMARCA2, Length 939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCA2-231	ENST00000634931	TNFSF10	P50591	281 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	LRRC63	Q05C16	580 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	ILK	Q13418	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	LY6D	Q14210	128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	KRT31	Q15323	416 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931		Q6ZSR6	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	TMEM110	Q86TL2	294 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	NELFB	Q8WX92	580 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	LGMN	Q99538	433 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	PIGV	Q9NUD9	493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	DDIT4	Q9NX09	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	SPAST	Q9UBP0	616 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	ETV7	Q9Y603	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	KALRN	O60229	2985 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	ATM	Q13315	3056 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931		A0A0D9SEW6	157 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	C10orf142	B7Z368	130 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	BMPR1B	O00238	502 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	MED7	O43513	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	SYT7	O43581	403 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	CS	O75390	466 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	SAP30	O75446	220 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	MT-ATP6	P00846	226 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	CTSL	P07711	333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	SLC2A3	P11169	496 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	SKIL	P12757	684 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	ETS1	P14921	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	ITGB6	P18564	788 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	PLK1	P53350	603 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	OVGP1	Q12889	678 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	CEACAM7	Q14002	265 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	CDKN3	Q16667	212 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	DUSP5	Q16690	384 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	TRIM69	Q86WT6	500 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	HORMAD1	Q86X24	394 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	ERICH1	Q86X53	443 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	KDM8	Q8N371	416 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	TRPV3	Q8NET8	790 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR4C6	Q8NH72	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	BMF	Q96LC9	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	CPXM1	Q96SM3	734 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	DYRK4	Q9NR20	520 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	HPF1	Q9NWY4	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	IFNK	Q9P0W0	207 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931		A0A087WZ39	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	CFAP73	A6NFT4	308 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	IGLON5	A6NGN9	336 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	MSGN1	A6NI15	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931		J3QKU1	62 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	RAD51B	O15315	384 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	TXNL1	O43396	289 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	CLDN11	O75508	207 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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