RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629179.1

PNKP-223, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 4

Gene PNKP, Length 811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-223	ENST00000629179	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	CBLN3	Q6UW01	205 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	RNF130	Q86XS8	419 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	MEIOB	Q8N635	442 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	TM9SF2	Q99805	663 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	EXD2	Q9NVH0	621 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	FBN2	P35556	2912 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179		H3BNH8	94 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	TGDS	O95455	350 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	IL6	P05231	212 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	OPRM1	P35372	400 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	KHK	P50053	298 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	IDH3A	P50213	366 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	FUT5	Q11128	374 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	POC1B	Q8TC44	478 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	FIG4	Q92562	907 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	RNF145	Q96MT1	663 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	EBF4	Q9BQW3	602 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	PINK1	Q9BXM7	581 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	TACC2	O95359	2948 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	SLC22A20	A6NK97	555 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	SYT5	O00445	386 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	HMGN4	O00479	90 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	RFXANK	O14593	260 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	UGT2B17	O75795	530 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	NUDT14	O95848	222 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	AGR2	O95994	175 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	IL18BP	O95998	194 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	LINGO3	P0C6S8	592 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF17	P17021	662 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	IL11	P20809	199 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	UQCRC1	P31930	480 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	ASCL1	P50553	236 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	P2RX1	P51575	399 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF141	Q15928	474 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	COX20	Q5RI15	118 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	GGN	Q86UU5	652 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	MIER2	Q8N344	545 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	GPR119	Q8TDV5	335 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	VPS33A	Q96AX1	596 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF524	Q96C55	264 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	ROPN1L	Q96C74	230 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	C7orf72	A4D263	438 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	SERINC4	A6NH21	518 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF264	O43296	627 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	EFNA2	O43921	213 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	SSTR2	P30874	369 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	AQP5	P55064	265 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	KRTAP10-9	P60411	292 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	TLE4	Q04727	773 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PNKP-223	ENST00000629179	FOXF1	Q12946	379 aa		12.78	□□□□□ -0.36

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