RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A0G2JPF8	293 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495		A8MXK9	166 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	PTGES3L	E9PB15	166 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	GFY	I3L273	518 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	PSMD9	O00233	223 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	TAPBP	O15533	448 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	SEC14L5	O43304	696 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	DLX3	O60479	287 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM13	O60858	407 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	OR4F21	O95013	312 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV2-70	P01814	119 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	CBSL	P0DN79	551 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	PTAFR	P25105	342 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	RORA	P35398	523 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	CBS	P35520	551 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP12A	P54707	1039 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	C21orf58	P58505	322 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	FOXK2	Q01167	660 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	HMGCS1	Q01581	520 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	DOC2A	Q14183	400 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	LCN10	Q6JVE6	187 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	KRT78	Q8N1N4	520 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	ELP4	Q96EB1	424 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	F2RL3	Q96RI0	385 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	MED18	Q9BUE0	208 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	REG4	Q9BYZ8	158 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	PIGU	Q9H490	435 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	SCN3B	Q9NY72	215 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A087X1B8	175 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1W2PPL8	197 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1W2PPV9	198 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2A25	A4D2G3	310 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495		A8MT66	165 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	NKX2-8	O15522	239 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	P2RX6	O15547	441 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAJB6	O75190	326 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	RDH16	O75452	317 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	PRSS23	O95084	383 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	CHRNG	P07510	517 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	DLST	P36957	453 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	BCL6	P41182	706 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	ALDH9A1	P49189	494 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	STX4	Q12846	297 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	KIR2DS3	Q14952	304 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	CYP51A1	Q16850	503 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF691	Q5VV52	312 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	SZRD1	Q7Z422	152 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	METTL6	Q8TCB7	284 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	FGF11	Q92914	225 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	C19orf60	Q96EN9	201 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	PEX11G	Q96HA9	241 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	COPS4	Q9BT78	406 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	C5AR2	Q9P296	337 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		6.74	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	6.73	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	PRMT3	O60678	531 aa		6.73	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	KERA	O60938	352 aa		6.73	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	SOX30	O94993	753 aa		6.73	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	MTHFD2	P13995	350 aa		6.73	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	AGXT	P21549	392 aa		6.73	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	CCR8	P51685	355 aa		6.73	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	ITGA1	P56199	1179 aa		6.73	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	ISL1	P61371	349 aa		6.73	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC35A2	P78381	396 aa		6.73	□□□□□ -1.33

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