RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 C6orf52Q5T4I8 152 aa11□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 TMEM205Q6UW68 189 aa11□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 CMIPQ8IY22 773 aa11□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 OR4D11Q8NGI4 311 aa11□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 OR1N1Q8NGS0 311 aa11□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 SLC2A12Q8TD20 617 aa11□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 GIPC3Q8TF64 312 aa11□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 PIK3R3Q92569 461 aa11□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 TSLPQ969D9 159 aa11□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 CNPPD1Q9BV87 410 aa11□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 DDA1Q9BW61 102 aa11□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 HOXD1Q9GZZ0 328 aa11□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 ARMC7Q9H6L4 198 aa11□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 APMAPQ9HDC9 416 aa11□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 CTSFQ9UBX1 484 aa11□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 MKLN1Q9UL63 735 aa11□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 A4GNTQ9UNA3 340 aa11□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 SPTBP11277 2137 aa11□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 GXYLT2A0PJZ3 443 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 FRG2CA6NGY1 282 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 IDSB3KWA1 339 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 NME6O75414 186 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 UGT2B17O75795 530 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 GADD45GO95257 159 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 RPSAP08865 295 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 ITGAMP11215 1152 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 IL7RP16871 459 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 DAPP51397 102 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 IL18R1Q13478 541 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 LIN52Q52LA3 116 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 NPSR1Q6W5P4 371 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 COMTD1Q86VU5 262 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 VRK2Q86Y07 508 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 OFCC1Q8IZS5 231 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 NLGN4XQ8N0W4 816 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 OR6T1Q8NGN1 323 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 OR8K3Q8NH51 312 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 ADIPOR1Q96A54 375 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 TP53INP1Q96A56 240 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 PRRC1Q96M27 445 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 SPSB2Q99619 263 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 SMURF2Q9HAU4 748 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 FAM118AQ9NWS6 357 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 SLC39A1Q9NY26 324 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 UBAP1Q9NZ09 502 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 KCNE5Q9UJ90 142 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 SLC13A4Q9UKG4 626 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 U3KQV3 271 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 PCSK5Q92824 1860 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 A0A1W2PQ72 361 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 CDHR4A6H8M9 788 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 ALOX12BO75342 701 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 SNAP29O95721 258 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 IL33O95760 270 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 H1F0P07305 194 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 PRKACGP22612 351 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 IFNA8P32881 189 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 PGDP52209 483 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 CHN2P52757 468 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 ATP12AP54707 1039 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 EMP2P54851 167 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 NPTX1Q15818 432 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 MAPK14Q16539 360 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 DCAF12Q5T6F0 453 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 CD300LDQ6UXZ3 194 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 OLIG3Q7RTU3 272 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 ANKRD37Q7Z713 158 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 LACC1Q8IV20 430 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 HS3ST5Q8IZT8 346 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 PARP8Q8N3A8 854 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 CLIP4Q8N3C7 705 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 ZNF441Q8N8Z8 693 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 DOK4Q8TEW6 326 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 HSPBAP1Q96EW2 488 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 ALPK1Q96QP1 1244 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 MBOAT4Q96T53 435 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 WFDC6Q9BQY6 131 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 NUDT9Q9BW91 350 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 ITPAQ9BY32 194 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
GGA3-217ENST00000583667 BATF3Q9NR55 127 aa10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms