RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 SETD6Q8TBK2 473 aa2.05□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 FBXO25Q8TCJ0 367 aa2.05□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 FGF13Q92913 245 aa2.05□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 C16orf74Q96GX8 76 aa2.05□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 SERINC2Q96SA4 455 aa2.05□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 SSX3Q99909 188 aa2.05□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 NT5C3AQ9H0P0 336 aa2.05□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 TMEM245Q9H330 911 aa2.05□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 Q9HAA7 133 aa2.05□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 TAS2R16Q9NYV7 291 aa2.05□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 ANAPC5Q9UJX4 755 aa2.05□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 OR1A2Q9Y585 309 aa2.05□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 FOCADQ5VW36 1801 aa2.05□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 HERC2O95714 4834 aa2.05□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 RYR2Q92736 4967 aa2.05□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 ESYT2A0FGR8 921 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 ARHGEF37A1IGU5 675 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 TCP11X1B4DZS4 312 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 EMC8O43402 210 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 RAD51DO75771 328 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 GH1P01241 217 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 RLN1P04808 185 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 ZP3P21754 424 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 BCKDHBP21953 392 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 OR1D2P34982 312 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 UQCRFS1P47985 274 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 NT5C2P49902 561 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 ARHGDIBP52566 201 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 KRTAP10-10P60014 251 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 GABPAQ06546 454 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 ARHGAP1Q07960 439 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 SPHARQ15513 63 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 ACKR1Q16570 336 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 SDK2Q58EX2 2172 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 PAGE2BQ5JRK9 111 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 DCAF12Q5T6F0 453 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 VPS13CQ709C8 3753 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 LPCAT2Q7L5N7 544 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 LRRC43Q8N309 656 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 SIPA1Q96FS4 1042 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 INTS14Q96SY0 518 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 S1PR3Q99500 378 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 C19orf24Q9BVV8 132 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 TRIM9Q9C026 710 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 TMEM117Q9H0C3 514 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 RAB26Q9ULW5 256 aa2.04□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 LCTP09848 1927 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 MYLKQ15746 1914 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 MAGEB16A2A368 324 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 B4DXG7 233 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 CTDSPLO15194 276 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 ZNF286BP0CG31 522 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 PVRP15151 417 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 CD52P31358 61 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 SLC7A2P52569 658 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 EFNA3P52797 238 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 SLC12A3P55017 1021 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 MGAT3Q09327 533 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 KRT31Q15323 416 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 OR1C1Q15619 314 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 USH1GQ495M9 461 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 RHBDD2Q6NTF9 364 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 IRGCQ6NXR0 463 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 APOOLQ6UXV4 268 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 TMEM179Q6ZVK1 233 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 LSMEM1Q8N8F7 131 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 LINC01555Q8NAE3 123 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 C9orf85Q96MD7 179 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 POLR3GLQ9BT43 218 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 ZNF702PQ9H963 129 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 TMEM161AQ9NX61 479 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 CYP39A1Q9NYL5 469 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 KLK12Q9UKR0 248 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 ERVK-19Q9WJR5 959 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 NUDCQ9Y266 331 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 KNSTRNQ9Y448 316 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 ATG4BQ9Y4P1 393 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 VWA8A3KMH1 1905 aa2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 HELZP42694 1942 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
RRN3-204ENST00000561685 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms