RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	PPP1CA	P62136	330 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TBPL1	P62380	186 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ASPH	Q12797	758 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CHIT1	Q13231	466 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CFAP157	Q5JU67	520 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CGB2	Q6NT52	195 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SYVN1	Q86TM6	617 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CUZD1	Q86UP6	607 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SNX31	Q8N9S9	440 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	BBS10	Q8TAM1	723 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	AGR3	Q8TD06	166 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	MAPK15	Q8TD08	544 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ATL1	Q8WXF7	558 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SMPDL3A	Q92484	453 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	FIG4	Q92562	907 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	MED8	Q96G25	268 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	KCNA7	Q96RP8	456 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	OPTC	Q9UBM4	332 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TAC3	Q9UHF0	121 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PCTP	Q9UKL6	214 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	VDAC3	Q9Y277	283 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TIMM22	Q9Y584	194 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934		U3KQA8	63 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	VCAN	P13611	3396 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	OR6C74	A6NCV1	312 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	OR5K3	A6NET4	321 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934		E7EQ34	232 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PROB1	E7EW31	1015 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CAPN1	P07384	714 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF883	P0CG24	379 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CD59	P13987	128 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	DAO	P14920	347 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PVR	P15151	417 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	UGT2B7	P16662	529 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ITGA2	P17301	1181 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	AMD1	P17707	334 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CD22	P20273	847 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CD1C	P29017	333 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PKLR	P30613	574 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SHMT2	P34897	504 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SLC15A1	P46059	708 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CD81	P60033	236 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	IRF8	Q02556	426 aa		4.12	□□□□□ -1.75

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