RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560631.1

RNF31-222, Transcript of ring finger protein 31, human

TSL 2

Gene RNF31, Length 320 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF31-222	ENST00000560631	CASP9	P55211	416 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	DLX5	P56178	289 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	HSF1	Q00613	529 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	CHRNE	Q04844	493 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	STX5	Q13190	355 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	GNA13	Q14344	377 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	FGFBP1	Q14512	234 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	GPR68	Q15743	365 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	GXYLT1	Q4G148	440 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	GPAT3	Q53EU6	434 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	WLS	Q5T9L3	541 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	MTFR2	Q6P444	385 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	GALNT10	Q86SR1	603 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	ANKFN1	Q8N957	763 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	ITPKC	Q96DU7	683 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	TIMP4	Q99727	224 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	LAT2	Q9GZY6	243 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	MKLN1	Q9UL63	735 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	HCFC1	P51610	2035 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631		A0A0G2JPF8	293 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	AGAP5	A6NIR3	686 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	C17orf51	A8MQB3	221 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	ANGPT2	O15123	496 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	ZNF264	O43296	627 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	SEMA7A	O75326	666 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	NR2F1	P10589	423 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	ETS2	P15036	469 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	ZNF17	P17021	662 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	BMP7	P18075	431 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	AGA	P20933	346 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	ADH6	P28332	368 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	PRDX6	P30041	224 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	PTGER4	P35408	488 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	GCK	P35557	465 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	PGM1	P36871	562 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	CRISP3	P54108	245 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	PER3	P56645	1201 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	KCNJ10	P78508	379 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	RBBP4	Q09028	425 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	NFYC	Q13952	458 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	CD226	Q15762	336 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	MAPK14	Q16539	360 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	AAGAB	Q6PD74	315 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RNF31-222	ENST00000560631	CD163	Q86VB7	1156 aa		7.28	□□□□□ -1.24

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