RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557654.5

GPHN-215, Transcript of gephyrin, human

TSL 4

Gene GPHN, Length 503 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPHN-215	ENST00000557654	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	RANBP9	Q96S59	729 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	DOK1	Q99704	481 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	LIME1	Q9H400	295 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	TMEM206	Q9H813	350 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	ARMCX1	Q9P291	453 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	POMP	Q9Y244	141 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	PLLP	Q9Y342	182 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	COL4A1	P02462	1669 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654		A0A0B4J203	849 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654		A0A1W2PQ72	361 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	FUOM	A2VDF0	154 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	CCDC160	A6NGH7	325 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	SERINC4	A6NH21	518 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	KLLN	B2CW77	178 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654		E9PAM4	449 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654		H3BSA7	217 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	FBP2	O00757	339 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	TXNDC9	O14530	226 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	MAGEB3	O15480	346 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	BPGM	P07738	259 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	THRA	P10827	490 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	S100A1	P23297	94 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	BCAP31	P51572	246 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	AQP5	P55064	265 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	KDSR	Q06136	332 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	GABPA	Q06546	454 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	DPYS	Q14117	519 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	TFDP1	Q14186	410 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	TGFBI	Q15582	683 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	ZBED5	Q49AG3	693 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	MUC21	Q5SSG8	566 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	LGSN	Q5TDP6	509 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	IL23R	Q5VWK5	629 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	CYS1	Q717R9	158 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	PDIK1L	Q8N165	341 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	GPD1L	Q8N335	351 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	SERAC1	Q96JX3	654 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	ACCS	Q96QU6	501 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	SERPINI1	Q99574	410 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	PINK1	Q9BXM7	581 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	ACP6	Q9NPH0	428 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	RAB20	Q9NX57	234 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	GAK	O14976	1311 aa		3.73	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		3.73	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		3.73	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	IGLON5	A6NGN9	336 aa		3.73	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		3.73	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		3.73	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654		H3BNH8	94 aa		3.73	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	CHAD	O15335	359 aa		3.73	□□□□□ -1.81
GPHN-215	ENST00000557654	MSH4	O15457	936 aa		3.73	□□□□□ -1.81

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