RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557428.1

PCNX1-215, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCNX1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-215ENST00000557428 FRG2BQ96QU4 278 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 BBS4Q96RK4 519 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 HBEGFQ99075 208 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 NPAS1Q99742 590 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 SRXN1Q9BYN0 137 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 ELOVL6Q9H5J4 265 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 PPCSQ9HAB8 311 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 NPAP1Q9NZP6 1156 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 KLHL13Q9P2N7 655 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 PRSS50Q9UI38 385 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 ACOT9Q9Y305 439 aa7.13□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 A0A1W2PR80 420 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 TLDC2A0PJX2 215 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 TRIM49D1C9J1S8 452 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 C9JVG2 144 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 H7C417 338 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 OR7A17O14581 309 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 RAD51DO75771 328 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 C2P06681 752 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 IL3P08700 152 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 DHRS4L1P0CG22 281 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 BMP4P12644 408 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 GGT1P19440 569 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 NR4A2P43354 598 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 SERPINB8P50452 374 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 EFNA4P52798 201 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 CHRNB3Q05901 458 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 C17orf67Q0P5P2 114 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 FAM83EQ2M2I3 478 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 GRAMD1BQ3KR37 738 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 KLHL17Q6TDP4 642 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 TMEM107Q6UX40 140 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 B3GLCTQ6Y288 498 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 Q6ZSR9 355 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 FCRLAQ7L513 359 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 TDRPQ86YL5 185 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 L3MBTL4Q8NA19 623 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 RNF128Q8TEB7 428 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 DCAKDQ8WVC6 231 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 SELENOMQ8WWX9 145 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 RADILQ96JH8 1075 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF681Q96N22 645 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 VPS11Q9H270 941 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 Q9N2J8 555 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 TIGARQ9NQ88 270 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 PLCE1Q9P212 2302 aa7.12□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 A0A087WZY1 265 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 A0A096LPK6 155 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 A0A1W2PRB8 838 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 CIB4A0PJX0 185 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 HMX2A2RU54 273 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 LRP5LA4QPB2 252 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 SMIM23A6NLE4 172 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 CCT8L1PA6NM43 557 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 PRKD3O94806 890 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 VENTXO95231 258 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 NUDT14O95848 222 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 PDYNP01213 254 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 SHBGP04278 402 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 JUNP05412 331 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 MTHFD2P13995 350 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 SHC1P29353 583 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 RAC1P63000 192 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 PSG6Q00889 435 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 MLC1Q15049 377 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 TMEM44Q2T9K0 475 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 PLPPR5Q32ZL2 321 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 KLC3Q6P597 504 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 TIFABQ6ZNK6 161 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 Q6ZT83 130 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 SZRD1Q7Z422 152 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 EXOC3L1Q86VI1 746 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF100Q8IYN0 542 aa7.11□□□□□ -1.27
PCNX1-215ENST00000557428 LILRA2Q8N149 483 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms