RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555894.5

TTC7B-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, human

TSL 3

Gene TTC7B, Length 738 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC7B-208	ENST00000555894	ZNF117	Q03924	483 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	OR10D3	Q8NH80	312 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	NPAS1	Q99742	590 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	NUF2	Q9BZD4	464 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	DUXA	A6NLW8	204 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	AQP8	O94778	261 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	SYNGR4	O95473	234 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	OPN1LW	P04000	364 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	LBP	P18428	481 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	MATN1	P21941	496 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	CD79B	P40259	229 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	KCNJ5	P48544	419 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	FAM27E3	Q08E93	113 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	BST1	Q10588	318 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	POU4F3	Q15319	338 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	KLHL26	Q53HC5	615 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	HAO1	Q9UJM8	370 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	PROCR	Q9UNN8	238 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	ITPR3	Q14573	2671 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	TNFSF11	O14788	317 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	CXCL13	O43927	109 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	AK1	P00568	194 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	LINGO3	P0C6S8	592 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	CD8B	P10966	210 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	POU2F1	P14859	743 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	SLC6A8	P48029	635 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	P2RX1	P51575	399 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	CTBP2	P56545	445 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	FOXF1	Q12946	379 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	HBM	Q6B0K9	141 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	CBLN3	Q6UW01	205 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	ANKRD46	Q86W74	232 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	LILRA2	Q8N149	483 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	POC1B	Q8TC44	478 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	KLHL15	Q96M94	604 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	PNPO	Q9NVS9	261 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	TMEM120B	A0PK00	339 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	ADAMDEC1	O15204	470 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	OIP5	O43482	229 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	CGA	P01215	116 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	HRG	P04196	525 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	ELK4	P28324	431 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	SFTPD	P35247	375 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	PCYT1A	P49585	367 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	CCR4	P51679	360 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	GUSBP1	Q15486	140 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	GPR68	Q15743	365 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TTC7B-208	ENST00000555894	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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