RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533817.5

TSTA3-216, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-216ENST00000533817 PMM1Q92871 262 aa13.44□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 WDYHV1Q96HA8 205 aa13.44□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 TMEM19Q96HH6 336 aa13.44□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 SFXN2Q96NB2 322 aa13.44□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 ANKRD27Q96NW4 1050 aa13.44□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 NPAS1Q99742 590 aa13.44□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 VKORC1Q9BQB6 163 aa13.44□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 CCDC106Q9BWC9 280 aa13.44□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 A4GALTQ9NPC4 353 aa13.44□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 FAM215AQ9Y5M1 114 aa13.44□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 A0A087WZY1 265 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 OR2M5A3KFT3 312 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 AGAP5A6NIR3 686 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 BBIP1A8MTZ0 92 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 FXYD1O00168 92 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 ZNF264O43296 627 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 ZG16O60844 167 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 WDR1O75083 606 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 CPN1P15169 458 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 ACVR2AP27037 513 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 GCKP35557 465 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 PGM1P36871 562 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 LHX2P50458 406 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 CRISP3P54108 245 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 PER3P56645 1201 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 ADORA2A-AS1P86434 159 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 SKP2Q13309 424 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 SELPLGQ14242 412 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 PLPPR5Q32ZL2 321 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 RAET1LQ5VY80 246 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 REP15Q6BDI9 236 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 RTL6Q6ICC9 239 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 AAGABQ6PD74 315 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 HEATR5AQ86XA9 2040 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 FAM71CQ8NEG0 241 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 OR5M1Q8NGP8 315 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 MAL2Q969L2 176 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 TRIM8Q9BZR9 551 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 MYLK2Q9H1R3 596 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 MED17Q9NVC6 651 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 CALML5Q9NZT1 146 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 CORO2BQ9UQ03 480 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 VDAC3Q9Y277 283 aa13.43□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 LOC100653049A0A140TA62 436 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 C7orf72A4D263 438 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 CLDN24A6NM45 220 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 FIGNL2A6NMB9 653 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 EVPLLA8MZ36 301 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 SHISA8B8ZZ34 492 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 MRASO14807 208 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 DNAJA2O60884 412 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 KRT34O76011 436 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 CSTAP01040 98 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 LINGO3P0C6S8 592 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 ARAFP10398 606 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 GABRA1P14867 456 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 ZNF17P17021 662 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 STARP49675 285 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 MTPNP58546 118 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 GCNT6Q5T4J0 391 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 C1orf185Q5T7R7 199 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 MTFR2Q6P444 385 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 ENPP6Q6UWR7 440 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 PIGWQ7Z7B1 504 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 TREML1Q86YW5 311 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 PM20D2Q8IYS1 436 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 EID3Q8N140 333 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 OR5W2Q8NH69 310 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 POC1BQ8TC44 478 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 GPR119Q8TDV5 335 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 ZNF524Q96C55 264 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 ARSGQ96EG1 525 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 PIGQQ9BRB3 760 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 LAT2Q9GZY6 243 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 CAMK2AQ9UQM7 478 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa13.42□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa13.41□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa13.41□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 A0A0G2JPF8 293 aa13.41□□□□□ -0.26
TSTA3-216ENST00000533817 AHRRA9YTQ3 701 aa13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.1 ms