RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516908.1

RNU6-352P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 352, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-352P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-352P-201ENST00000516908 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 MAT2BQ9NZL9 334 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 PLLPQ9Y342 182 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 HEATR5AQ86XA9 2040 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 MED12LQ86YW9 2145 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 DOCK7Q96N67 2140 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 PRR14LQ5THK1 2151 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 CCDC151A5D8V7 595 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 OR5H15A6NDH6 313 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 SYCE1LA8MT33 242 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 FAM166BA8MTA8 275 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 NPIPA7E9PJI5 369 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 C19orf84I3L1E1 186 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 COPEO14579 308 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 PCDH7O60245 1069 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 CBX6O95503 412 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 IFNA16P05015 189 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 BPGMP07738 259 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 RBP1P09455 135 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 NPIPA8P0DM63 369 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 CPA3P15088 417 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 SDC1P18827 310 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 TNFRSF1AP19438 455 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 IMPDH1P20839 514 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 GPX3P22352 226 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 HRH2P25021 359 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 PTGDSP41222 190 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 RAP1GDS1P52306 607 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 SLC37A1P57057 533 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 FBXW4P57775 412 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 TAS2R50P59544 299 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 ADORA2A-AS1P86434 159 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 ASPHQ12797 758 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 LCP2Q13094 533 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 GAB1Q13480 694 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 KIAA0040Q15053 153 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 EBPQ15125 230 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 OR1C1Q15619 314 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 AP5B1Q2VPB7 878 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZNF628Q5EBL2 1059 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 XKR7Q5GH72 579 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 CEP85LQ5SZL2 805 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 PRAMEF20Q5VT98 475 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 LIPJQ5W064 366 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 TRIM40Q6P9F5 258 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 CYB5D1Q6P9G0 228 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 EMBQ6PCB8 327 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 IGFL3Q6UXB1 125 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 HMGN2P46Q86SG4 172 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 GPR180Q86V85 440 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZNF781Q8N8C0 355 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZNF615Q8N8J6 731 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 TEX19Q8NA77 164 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 B3GNT7Q8NFL0 401 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 OR7G2Q8NG99 324 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 OR10G3Q8NGC4 313 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 OR52L2PQ8NGH6 319 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 OR9A2Q8NGT5 310 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 ACMSDQ8TDX5 336 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 PPP4R1Q8TF05 950 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 CMTM7Q96FZ5 175 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 SCMH1Q96GD3 660 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 FAR2Q96K12 515 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 FCRL1Q96LA6 429 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 TEX37Q96LM6 180 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 AGAP4Q96P64 663 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 TSSK3Q96PN8 268 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 GAL3ST4Q96RP7 486 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 RASL10BQ96S79 203 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 TBCDQ9BTW9 1192 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 TUBB6Q9BUF5 446 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-352P-201ENST00000516908 EFHD1Q9BUP0 239 aa3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98 ms