RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ALYREF-203ENST00000511412 CXorf36Q9H7Y0 433 aa22.09■■□□□ 1.13
ALYREF-203ENST00000511412 UBTD1Q9HAC8 227 aa22.09■■□□□ 1.13
ALYREF-203ENST00000511412 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ALYREF-203ENST00000511412 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa22.09■■□□□ 1.13
ALYREF-203ENST00000511412 GLRX2Q9NS18 164 aa22.09■■□□□ 1.13
ALYREF-203ENST00000511412 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa22.09■■□□□ 1.13
ALYREF-203ENST00000511412 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ALYREF-203ENST00000511412 C6orf47O95873 294 aa22.08■■□□□ 1.13
ALYREF-203ENST00000511412 ELK4P28324 431 aa22.08■■□□□ 1.13
ALYREF-203ENST00000511412 EIF1P41567 113 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF117Q03924 483 aa22.08■■□□□ 1.13
ALYREF-203ENST00000511412 FOXF1Q12946 379 aa22.08■■□□□ 1.13
ALYREF-203ENST00000511412 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ALYREF-203ENST00000511412 DCST2Q5T1A1 773 aa22.08■■□□□ 1.13
ALYREF-203ENST00000511412 SFXN5Q8TD22 340 aa22.08■■□□□ 1.13
ALYREF-203ENST00000511412 PIGTQ969N2 578 aa22.08■■□□□ 1.13
ALYREF-203ENST00000511412 MOAP1Q96BY2 351 aa22.08■■□□□ 1.13
ALYREF-203ENST00000511412 KLHL15Q96M94 604 aa22.08■■□□□ 1.13
ALYREF-203ENST00000511412 PIP5K1AQ99755 562 aa22.08■■□□□ 1.13
ALYREF-203ENST00000511412 HOXD1Q9GZZ0 328 aa22.08■■□□□ 1.13
ALYREF-203ENST00000511412 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa22.07■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 A0A0J9YW62 118 aa22.07■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 NPIPA7E9PJI5 369 aa22.07■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 SMPD2O60906 423 aa22.07■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 BPGMP07738 259 aa22.07■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 LINGO3P0C6S8 592 aa22.07■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 NPIPA8P0DM63 369 aa22.07■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 PRPS1L1P21108 318 aa22.07■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 FPR1P21462 350 aa22.07■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 ANKRD34AQ69YU3 496 aa22.07■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 LILRA2Q8N149 483 aa22.07■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa22.07■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 TUBGCP3Q96CW5 907 aa22.07■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 C18orf12Q96KH6 178 aa22.07■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 MARK4Q96L34 752 aa22.07■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 HS3ST6Q96QI5 342 aa22.07■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 CCL19Q99731 98 aa22.07■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 FANCFQ9NPI8 374 aa22.07■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 GPATCH2Q9NW75 528 aa22.07■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 H3BNH8 94 aa22.06■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 ARHGEF9O43307 516 aa22.06■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 SOX30O94993 753 aa22.06■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 NUDT14O95848 222 aa22.06■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 PPP3CBP16298 524 aa22.06■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 IL11P20809 199 aa22.06■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 SFTPDP35247 375 aa22.06■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 ACKR1Q16570 336 aa22.06■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 BIVMQ86UB2 503 aa22.06■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 P3H2Q8IVL5 708 aa22.06■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa22.06■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 COQ8BQ96D53 544 aa22.06■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 CFLARO15519 480 aa22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 TUBBP07437 444 aa22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 CREB1P16220 341 aa22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 AGTR1P30556 359 aa22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 SOAT1P35610 550 aa22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 P2RX1P51575 399 aa22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 KLHL26Q53HC5 615 aa22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 Q5PR19 223 aa22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 EMBQ6PCB8 327 aa22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 CBLN3Q6UW01 205 aa22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 C20orf204Q6ZNR8 217 aa22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 BEND4Q6ZU67 534 aa22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 C22orf34Q6ZV56 151 aa22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 STK32CQ86UX6 486 aa22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF614Q8N883 585 aa22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 OR5AK3PQ8NH89 298 aa22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 NUDT8Q8WV74 236 aa22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 OSTF1Q92882 214 aa22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 DUSP26Q9BV47 211 aa22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 CARD8Q9Y2G2 431 aa22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 TYROBPO43914 113 aa22.04■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 G6PDP11413 515 aa22.04■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 ADH6P28332 368 aa22.04■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 SHC1P29353 583 aa22.04■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 ETV4P43268 484 aa22.04■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 CARD18P57730 90 aa22.04■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 BHLHB9Q6PI77 547 aa22.04■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 STAC2Q6ZMT1 411 aa22.04■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 RIMKLAQ8IXN7 391 aa22.04■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa22.04■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 RNF128Q8TEB7 428 aa22.04■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 OR7D2Q96RA2 312 aa22.04■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 C12orf49Q9H741 205 aa22.04■■□□□ 1.12
ALYREF-203ENST00000511412 TIGARQ9NQ88 270 aa22.04■■□□□ 1.12
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