RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
NISCH-214ENST00000490425 SLC6A13Q9NSD5 602 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-214ENST00000490425 MED17Q9NVC6 651 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-214ENST00000490425 ZIM2Q9NZV7 527 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-214ENST00000490425 CLCF1Q9UBD9 225 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-214ENST00000490425 KCNE5Q9UJ90 142 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-214ENST00000490425 MKLN1Q9UL63 735 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-214ENST00000490425 DTNAQ9Y4J8 743 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-214ENST00000490425 MED12LQ86YW9 2145 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-214ENST00000490425 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 H3BNH8 94 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 STX11O75558 287 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 NUDT14O95848 222 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 AK1P00568 194 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 CTSSP25774 331 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 UQCRC1P31930 480 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 KHKP50053 298 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 AQP5P55064 265 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 FUT5Q11128 374 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 MAPK14Q16539 360 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 TIGD2Q4W5G0 525 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 COX20Q5RI15 118 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 ATAD3BQ5T9A4 648 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 CHMP1BQ7LBR1 199 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 GDF7Q7Z4P5 450 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 HMGN2P46Q86SG4 172 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 GCNT2Q8N0V5 402 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 MIER2Q8N344 545 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 RFWD2Q8NHY2 731 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 POC1BQ8TC44 478 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 CKAP2Q8WWK9 683 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 FIG4Q92562 907 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 WNT2BQ93097 391 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 VPS33AQ96AX1 596 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 ROPN1LQ96C74 230 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 ARSGQ96EG1 525 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 UCN2Q96RP3 112 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 TM9SF2Q99805 663 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 ZNF350Q9GZX5 532 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 TMEM185BQ9H7F4 350 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 HHATLQ9HCP6 504 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 TCF7L2Q9NQB0 619 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 EXD2Q9NVH0 621 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 ZNF446Q9NWS9 450 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 OTOGQ6ZRI0 2925 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 SPG11Q96JI7 2443 aa10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 CCDC168Q8NDH2 2452 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 SERINC4A6NH21 518 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 SLC22A20A6NK97 555 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 LINC01387J3KSC0 135 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 HMGN4O00479 90 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 RFXANKO14593 260 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 UGT2B17O75795 530 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 RCBTB2O95199 551 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 TGDSO95455 350 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 AGR2O95994 175 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 IL6P05231 212 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 LINGO3P0C6S8 592 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 ZNF17P17021 662 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 IL11P20809 199 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 CCR4P51679 360 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 GTDC1Q4AE62 458 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 GPAT3Q53EU6 434 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 P4HA3Q7Z4N8 544 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 GGNQ86UU5 652 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 TRIML2Q8N7C3 387 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 ZBTB8AQ96BR9 441 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 ZNF524Q96C55 264 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 ZG16BQ96DA0 208 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 MAGEB18Q96M61 343 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 PINK1Q9BXM7 581 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 NMUR2Q9GZQ4 415 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 ICAM5Q9UMF0 924 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 WDR45Q9Y484 360 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 AP4B1Q9Y6B7 739 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 FAM234BA2RU67 622 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 C7orf72A4D263 438 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
NISCH-214ENST00000490425 ZNF264O43296 627 aa10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms