RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487841.5

SFT2D1-204, Transcript of SFT2 domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SFT2D1, Length 2,576 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1-204ENST00000487841 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 KATNB1Q9BVA0 655 aa11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 NLGN3Q9NZ94 848 aa11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 TBC1D24Q9ULP9 559 aa11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 MMP17Q9ULZ9 603 aa11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 CD8B2A6NJW9 211 aa11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 SNPHO15079 494 aa11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 CHST10O43529 356 aa11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 HRO43593 1189 aa11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 CD8BP10966 210 aa11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 NOS3P29474 1203 aa11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 YPEL5P62699 121 aa11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 PSPHP78330 225 aa11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 PSG6Q00889 435 aa11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 FZD5Q13467 585 aa11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 EOGTQ5NDL2 527 aa11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 OR51V1Q9H2C8 321 aa11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 POT1Q9NUX5 634 aa11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 COMMD3Q9UBI1 195 aa11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa11.86□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 ISPDA4D126 451 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 TRAPPC13A5PLN9 417 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 LRRN3E7EW58 273 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 PLOD3O60568 738 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 CBX7O95931 251 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 IGKV1D-16P01601 117 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 STAT5AP42229 794 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 SLC9A3P48764 834 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 EMDP50402 254 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 BNC1Q01954 994 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 SELENBP1Q13228 472 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 PLK5Q496M5 336 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 GJD3Q8N144 294 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 VWA5B2Q8N398 1253 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 CDRT4Q8N9R6 151 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 MINDY2Q8NBR6 621 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 FANK1Q8TC84 345 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 TP53INP1Q96A56 240 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 KCTD7Q96MP8 289 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 ZNF649Q9BS31 505 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 GSDMCQ9BYG8 508 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 MIXL1Q9H2W2 232 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 LRRN3Q9H3W5 708 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 CDH10Q9Y6N8 788 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 TMEM129A0AVI4 362 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 OR5K3A6NET4 321 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 SNTNA6NMZ2 147 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 TFECO14948 347 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 NGFRP08138 427 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 TBXA2RP21731 343 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 RABIFP47224 123 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 PGDP52209 483 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 RPS7P62081 194 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 NXNL2Q5VZ03 156 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 FAM131AQ6UXB0 335 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 ZNF485Q8NCK3 441 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 UFD1Q92890 307 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 BPIFA2Q96DR5 249 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 DIRAS2Q96HU8 199 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 CD180Q99467 661 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 MAP3K3Q99759 626 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 SP140LQ9H930 580 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 LYRM4Q9HD34 91 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 SPACA6W5XKT8 324 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 ASXL3Q9C0F0 2248 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 ABCA7Q8IZY2 2146 aa11.85□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 A0A075B6Q4 140 aa11.84□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 C12orf71A8MTZ7 269 aa11.84□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 SLC30A4O14863 429 aa11.84□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 BRINP1O60477 761 aa11.84□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 AGR2O95994 175 aa11.84□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 DBIP07108 87 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 MAOAP21397 527 aa11.84□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 IGFBP4P22692 258 aa11.84□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 GXYLT1Q4G148 440 aa11.84□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 RNF44Q7L0R7 432 aa11.84□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 DTX3Q8N9I9 347 aa11.84□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 PTP4A1Q93096 173 aa11.84□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 CLIP3Q96DZ5 547 aa11.84□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 SPACA7Q96KW9 195 aa11.84□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 IFT27Q9BW83 186 aa11.84□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 CPNE5Q9HCH3 593 aa11.84□□□□□ -0.51
SFT2D1-204ENST00000487841 DUSP22Q9NRW4 184 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms