RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 GRAMD1BQ3KR37 738 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 ZNF385BQ569K4 471 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 FAM91A1Q658Y4 838 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD34AQ69YU3 496 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 C6orf89Q6UWU4 347 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 TREML1Q86YW5 311 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 MEIOBQ8N635 442 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 FITM2Q8N6M3 262 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 ZNF610Q8N9Z0 462 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 CLHC1Q8NHS4 586 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 FBXO30Q8TB52 745 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 PIK3IP1Q96FE7 263 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 LRRC37BQ96QE4 947 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 HS3ST6Q96QI5 342 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 KLHDC3Q9BQ90 382 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 CCDC106Q9BWC9 280 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 Q9N2J8 555 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 TAS2R7Q9NYW3 318 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 ABCG2Q9UNQ0 655 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 AQP8O94778 261 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 ANGPTL1O95841 491 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 OPN1LWP04000 364 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 POU2F1P14859 743 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 UGT2B10P36537 528 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 GSTM5P46439 218 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 SLC6A8P48029 635 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 NME5P56597 212 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 PSPHP78330 225 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 LTBQ06643 244 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 KLF10Q13118 480 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 PTGR1Q14914 329 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 OR2A2Q6IF42 318 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 PPP4R4Q6NUP7 873 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 ZAR1Q86SH2 424 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 MIER2Q8N344 545 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 GATSQ8NAP1 163 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 OR9I1Q8NGQ6 314 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 SLC9A6Q92581 669 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 DTNBP1Q96EV8 351 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 TSSK3Q96PN8 268 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 MED18Q9BUE0 208 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 RNF122Q9H9V4 155 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 SDHAF3Q9NRP4 125 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 ZIM2Q9NZV7 527 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 CLEC4AQ9UMR7 237 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 VDAC3Q9Y277 283 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 CAPN7Q9Y6W3 813 aa11.35□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 ARID1AO14497 2285 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 CCT8L1PA6NM43 557 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 C9JVG2 144 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 SLC22A2O15244 555 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 AKAP10O43572 662 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 RRP9O43818 475 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 TNFRSF21O75509 655 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 CRHP06850 196 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 ACP2P11117 423 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 IL12AP29459 219 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 KCNJ5P48544 419 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 PRKAG1P54619 331 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 STX1BP61266 288 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 UFM1P61960 85 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 GANABQ14697 944 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 GUSBP1Q15486 140 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 TMEM44Q2T9K0 475 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 GGNQ86UU5 652 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 FUNDC1Q8IVP5 155 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 OR4C3Q8NH37 302 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 GPR151Q8TDV0 419 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 NUDT8Q8WV74 236 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 C18orf12Q96KH6 178 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 TEX37Q96LM6 180 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 PTGES2Q9H7Z7 377 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 UBTD1Q9HAC8 227 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 FBXO34Q9NWN3 711 aa11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 DSCAMO60469 2012 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 ZANQ9Y493 2812 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 PRR14LQ5THK1 2151 aa11.33□□□□□ -0.6
PRAME-212ENST00000485532 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms