RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 OR2W5A6NFC9 320 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 G3V3Q6 166 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 IFNA4P05014 189 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 F3P13726 295 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 RPS2P15880 293 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 FPR1P21462 350 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 E2F1Q01094 437 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 FGL1Q08830 312 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 LAPTM4AQ15012 233 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 NR0B2Q15466 257 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 UAP1L1Q3KQV9 507 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 LRRC73Q5JTD7 316 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 OR2T5Q6IEZ7 315 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 FAHD1Q6P587 224 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 HSDL2Q6YN16 418 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 CHMP1BQ7LBR1 199 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 ISCA2Q86U28 154 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 SERPINA9Q86WD7 417 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 KMT5CQ86Y97 462 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 OR2T29Q8NH02 315 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 OR10A6Q8NH74 314 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 KCNJ15Q99712 375 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 CDCP1Q9H5V8 836 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 SNTG1Q9NSN8 517 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 GPR83Q9NYM4 423 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 TAAR2Q9P1P5 351 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 NDRG3Q9UGV2 375 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 CA5BQ9Y2D0 317 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 OR56A5P0C7T3 313 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 RD3LP0DJH9 198 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 ANXA3P12429 323 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 ZNF81P51508 661 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 CTSCP53634 463 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 ST3GAL4Q11206 333 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 ARHGAP19Q14CB8 494 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 PON3Q15166 354 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 TRIQKQ629K1 86 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 SCIMPQ6UWF3 145 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 FAM92BQ6ZTR7 304 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 SLC35F3Q8IY50 421 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 ABCA7Q8IZY2 2146 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 OR4F6Q8NGB9 312 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 OR10J5Q8NHC4 309 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 SLC25A46Q96AG3 418 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 NXPE2Q96DL1 559 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 BBS4Q96RK4 519 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 APOL2Q9BQE5 337 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 MED28Q9H204 178 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 UFSP2Q9NUQ7 469 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 NCDNQ9UBB6 729 aa7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
USP4-211ENST00000485450 PCSK5Q92824 1860 aa7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ANKDD1BA6NHY2 528 aa7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CDRT15L2A8MXV6 281 aa7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 WRBO00258 174 aa7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 EML2O95834 649 aa7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SERPINA1P01009 418 aa7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PAMP19021 973 aa7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CFHR1Q03591 330 aa7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ITKQ08881 620 aa7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 DOC2BQ14184 412 aa7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ERICH5Q6P6B1 374 aa7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CLDN22Q8N7P3 220 aa7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 OR11H7Q8NGC8 314 aa7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 CD200R1Q8TD46 325 aa7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ROBO4Q8WZ75 1007 aa7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 NAT6Q93015 286 aa7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 WDR34Q96EX3 536 aa7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 TSPAN17Q96FV3 270 aa7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 MYOCQ99972 504 aa7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 SOSTQ9BQB4 213 aa7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PRR14Q9BWN1 585 aa7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 ALG9Q9H6U8 611 aa7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 VAPAQ9P0L0 249 aa7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 PISDQ9UG56 409 aa7.15□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 C7orf66A4D0T2 115 aa7.14□□□□□ -1.27
USP4-211ENST00000485450 TMEM8BA6NDV4 472 aa7.14□□□□□ -1.27
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