RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 FAM27E3Q08E93 113 aa11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 TP53BP2Q13625 1128 aa11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 NDUFAF6Q330K2 333 aa11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 VPS26BQ4G0F5 336 aa11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 OR4F3Q6IEY1 312 aa11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 BHLHB9Q6PI77 547 aa11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 CHMP1BQ7LBR1 199 aa11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 GGNQ86UU5 652 aa11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 CLECL1Q8IZS7 167 aa11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 COX18Q8N8Q8 333 aa11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 OR8J2Q8NGG1 315 aa11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 FNDC9Q8TBE3 224 aa11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 POC1BQ8TC44 478 aa11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 FAM222BQ8WU58 562 aa11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 OR5P2Q8WZ92 322 aa11.71□□□□□ -0.53
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HPS1-211ENST00000478087 SFXN3Q9BWM7 321 aa11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 BTBD2Q9BX70 525 aa11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 SERHL2Q9H4I8 314 aa11.71□□□□□ -0.53
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HPS1-211ENST00000478087 SLC24A3Q9HC58 644 aa11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 ZIM2Q9NZV7 527 aa11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 TRIM33Q9UPN9 1127 aa11.71□□□□□ -0.53
HPS1-211ENST00000478087 ZFHX3Q15911 3703 aa11.71□□□□□ -0.53
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HPS1-211ENST00000478087 A0A1W2PPR1 153 aa11.7□□□□□ -0.54
HPS1-211ENST00000478087 GOLGA8OA6NCC3 632 aa11.7□□□□□ -0.54
HPS1-211ENST00000478087 GOLGA8NF8WBI6 632 aa11.7□□□□□ -0.54
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HPS1-211ENST00000478087 EFNA2O43921 213 aa11.7□□□□□ -0.54
HPS1-211ENST00000478087 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.547e-6■■■■□ 20.7
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HPS1-211ENST00000478087 PON3Q15166 354 aa11.7□□□□□ -0.54
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HPS1-211ENST00000478087 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa11.7□□□□□ -0.54
HPS1-211ENST00000478087 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.54
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HPS1-211ENST00000478087 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa11.7□□□□□ -0.54
HPS1-211ENST00000478087 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
HPS1-211ENST00000478087 CBLN3Q6UW01 205 aa11.7□□□□□ -0.54
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HPS1-211ENST00000478087 TMEM185BQ9H7F4 350 aa11.7□□□□□ -0.54
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HPS1-211ENST00000478087 GPR45Q9Y5Y3 372 aa11.7□□□□□ -0.54
HPS1-211ENST00000478087 ARID1AO14497 2285 aa11.7□□□□□ -0.54
HPS1-211ENST00000478087 C2CD3Q4AC94 2353 aa11.69□□□□□ -0.54
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HPS1-211ENST00000478087 ANKRD28O15084 1053 aa11.69□□□□□ -0.54
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HPS1-211ENST00000478087 VIMP08670 466 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
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HPS1-211ENST00000478087 CPOXP36551 454 aa11.69□□□□□ -0.54
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HPS1-211ENST00000478087 ATP4BP51164 291 aa11.69□□□□□ -0.54
HPS1-211ENST00000478087 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
HPS1-211ENST00000478087 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
HPS1-211ENST00000478087 PLPPR5Q32ZL2 321 aa11.69□□□□□ -0.54
HPS1-211ENST00000478087 SPDYE7PQ495Y7 208 aa11.69□□□□□ -0.54
HPS1-211ENST00000478087 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
HPS1-211ENST00000478087 METTL21CQ5VZV1 264 aa11.69□□□□□ -0.54
HPS1-211ENST00000478087 SPNS3Q6ZMD2 512 aa11.69□□□□□ -0.54
HPS1-211ENST00000478087 C22orf34Q6ZV56 151 aa11.69□□□□□ -0.54
HPS1-211ENST00000478087 MAVSQ7Z434 540 aa11.69□□□□□ -0.54
HPS1-211ENST00000478087 ANKRD46Q86W74 232 aa11.69□□□□□ -0.54
HPS1-211ENST00000478087 MIER2Q8N344 545 aa11.69□□□□□ -0.54
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