RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 BCAP29Q9UHQ4 241 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 FBXL2Q9UKC9 423 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 RAP2CQ9Y3L5 183 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF175Q9Y473 711 aa6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 SLCO1B7G3V0H7 640 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 LINC01387J3KSC0 135 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 UPK1AO00322 258 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 KLF11O14901 512 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 NGFRP08138 427 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 KRT16P08779 473 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 LINC00032P0C843 101 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 ARRB2P32121 409 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 IDUAP35475 653 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 KRT20P35900 424 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 RPL14P50914 215 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 ATP5J2P56134 94 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 PRR5P85299 388 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 PSG6Q00889 435 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 EMX2Q04743 252 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 BTKQ06187 659 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 LTB4RQ15722 352 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 CHI3L2Q15782 390 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 CLEC12BQ2HXU8 276 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 AGBL2Q5U5Z8 902 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 P4HA3Q7Z4N8 544 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 DDIASQ8IXT1 998 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 FADS6Q8N9I5 356 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 CDRT4Q8N9R6 151 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 FIG4Q92562 907 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 MOAP1Q96BY2 351 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 PPCDCQ96CD2 204 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 ELP4Q96EB1 424 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 SFXN2Q96NB2 322 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 COL21A1Q96P44 957 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 MS4A4EQ96PG1 132 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 REG4Q9BYZ8 158 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 Q9N2J8 555 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 THAP1Q9NVV9 213 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa6.86□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 PRR14LQ5THK1 2151 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM233B4DJY2 109 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 SNNO75324 88 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 NKX2-2O95096 273 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 PLAUP00749 431 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 DANCRP0C864 163 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 NID1P14543 1247 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 DPP4P27487 766 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 IL12BP29460 328 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 SLC1A6P48664 564 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 LRRC74AQ0VAA2 488 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 DECR1Q16698 335 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 GALNTL6Q49A17 601 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 ATG16L1Q676U5 607 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 BHLHB9Q6PI77 547 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 NPSR1Q6W5P4 371 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 STAC2Q6ZMT1 411 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 CHMP1BQ7LBR1 199 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 RIMKLAQ8IXN7 391 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 METTL25Q8N6Q8 603 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 FNDC5Q8NAU1 212 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 OR8J2Q8NGG1 315 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 SFXN5Q8TD22 340 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 STON2Q8WXE9 905 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 KAT2AQ92830 837 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 TESCQ96BS2 214 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 TUBGCP3Q96CW5 907 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 COQ8BQ96D53 544 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 EGLN2Q96KS0 407 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 TSSK3Q96PN8 268 aa6.85□□□□□ -1.31
RBBP4-211ENST00000477563 STACQ99469 402 aa6.85□□□□□ -1.31
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