RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	MBD3	O95983	291 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	AK1	P00568	194 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	KRT13	P13646	458 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	PRG2	P13727	222 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	VDAC1	P21796	283 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	ADORA2B	P29275	332 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	ADSS	P30520	456 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	BDH1	Q02338	343 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	ST3GAL3	Q11203	375 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	MAPK6	Q16659	721 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	KYAT1	Q16773	422 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	NIPAL3	Q6P499	406 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	ARSK	Q6UWY0	536 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	CENPU	Q71F23	418 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334		Q8N7P7	452 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	LINC01006	Q8NI28	216 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	HAVCR1	Q96D42	359 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	C16orf74	Q96GX8	76 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	TPPP3	Q9BW30	176 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	PALMD	Q9NP74	551 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	SNX6	Q9UNH7	406 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	CLDN3	O15551	220 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	EFNA2	O43921	213 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	JAK2	O60674	1132 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	CABYR	O75952	493 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	CPN1	P15169	458 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	DLST	P36957	453 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	BDKRB1	P46663	353 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	STAR	P49675	285 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	SLC26A2	P50443	739 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	NUCB2	P80303	420 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	LINC01620	Q4KN68	170 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	CASC1	Q6TDU7	716 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	SLC34A3	Q8N130	599 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	OR2L5	Q8NG80	312 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	TXN2	Q99757	166 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	EHD1	Q9H4M9	534 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	B9D1	Q9UPM9	204 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	USP16	Q9Y5T5	823 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334		A0A087WZY1	265 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334		A0A1B0GUL7	405 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334		K7ENP7	123 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334	FCN1	O00602	326 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334	STS	P08842	583 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334	HBQ1	P09105	142 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334	OR8U8	P0C7N1	319 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334	PDHB	P11177	359 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334	TNNI3	P19429	210 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334	PSMA5	P28066	241 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334	RIPPLY3	P57055	190 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334	MARC2	Q969Z3	335 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334	TECTB	Q96PL2	329 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RBM39-231	ENST00000477334	CNPY3	Q9BT09	278 aa		2.96	□□□□□ -1.94

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