RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa9.63□□□□□ -0.87
NISCH-206ENST00000474188 CXorf36Q9H7Y0 433 aa9.63□□□□□ -0.87
NISCH-206ENST00000474188 GIMAP2Q9UG22 337 aa9.63□□□□□ -0.87
NISCH-206ENST00000474188 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa9.63□□□□□ -0.87
NISCH-206ENST00000474188 PRSS50Q9UI38 385 aa9.63□□□□□ -0.87
NISCH-206ENST00000474188 LIPT1Q9Y234 373 aa9.63□□□□□ -0.87
NISCH-206ENST00000474188 EMC9Q9Y3B6 208 aa9.63□□□□□ -0.87
NISCH-206ENST00000474188 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP9.62□□□□□ -0.87
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NISCH-206ENST00000474188 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
NISCH-206ENST00000474188 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa9.62□□□□□ -0.87
NISCH-206ENST00000474188 SHISA9B4DS77 424 aa9.62□□□□□ -0.87
NISCH-206ENST00000474188 C9JVG2 144 aa9.62□□□□□ -0.87
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NISCH-206ENST00000474188 SFRP5Q5T4F7 317 aa9.62□□□□□ -0.87
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NISCH-206ENST00000474188 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
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NISCH-206ENST00000474188 ZNF195O14628 629 aa9.6□□□□□ -0.87
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NISCH-206ENST00000474188 GSTM5P46439 218 aa9.6□□□□□ -0.87
NISCH-206ENST00000474188 CARD18P57730 90 aa9.6□□□□□ -0.87
NISCH-206ENST00000474188 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
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NISCH-206ENST00000474188 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
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