RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	MED17	Q9NVC6	651 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	MKLN1	Q9UL63	735 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880		A0A087WZY1	265 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PQD3	144 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	LINC01387	J3KSC0	135 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	RFXANK	O14593	260 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	AGR2	O95994	175 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	AK1	P00568	194 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	UBL4A	P11441	157 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	CPOX	P36551	454 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	CDKN2C	P42773	168 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	FOXF2	Q12947	444 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	BCL2A1	Q16548	175 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	GSTA3	Q16772	222 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	RNF130	Q86XS8	419 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	MIER2	Q8N344	545 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	WNT2B	Q93097	391 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC115	Q96NT0	180 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	AKAP6	Q13023	2319 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	TACC2	O95359	2948 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	SPG11	Q96JI7	2443 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	OIP5	O43482	229 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	FCMR	O60667	390 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	SCN2B	O60939	215 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	TGM6	O95932	706 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	SFTPD	P35247	375 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	CLDN15	P56746	228 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	FOXF1	Q12946	379 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	PON3	Q15166	354 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	KLHL26	Q53HC5	615 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	SAXO2	Q658L1	398 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	ACBD4	Q8NC06	268 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	FIG4	Q92562	907 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	ROPN1L	Q96C74	230 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	NEURL3	Q96EH8	262 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	C7orf26	Q96N11	449 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	NPAS1	Q99742	590 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	RMND5A	Q9H871	391 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	WDR45	Q9Y484	360 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	SERINC4	A6NH21	518 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	TNFSF11	O14788	317 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF264	O43296	627 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	RCBTB2	O95199	551 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	SYNGR4	O95473	234 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	CSTA	P01040	98 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	IL6	P05231	212 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF17	P17021	662 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	KIR2DL3	P43628	341 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	P2RX1	P51575	399 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	AQP5	P55064	265 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	DLX5	P56178	289 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	OR2A2	Q6IF42	318 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	CBLN3	Q6UW01	205 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	EPGN	Q6UW88	154 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	FBXO27	Q8NI29	283 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SSR4-208	ENST00000471880	VPS33A	Q96AX1	596 aa		13.34	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms