RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 CAPZBP47756 277 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 NDUFV1P49821 464 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SELENOVP59797 346 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ZP2Q05996 745 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ITKQ08881 620 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM187BQ17R55 369 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 C2orf27AQ580R0 203 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF311Q5JNZ3 666 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 PXKQ7Z7A4 578 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CBWD2Q8IUF1 395 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 OR4N4Q8N0Y3 316 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 OR5D18Q8NGL1 313 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 DNAJB14Q8TBM8 379 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 TBCKQ8TEA7 893 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 PAQR8Q8TEZ7 354 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 DNASE1L2Q92874 299 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SMIM12Q96EX1 92 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 KCTD7Q96MP8 289 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF382Q96SR6 550 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CBWD1Q9BRT8 395 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 TAPBPLQ9BX59 468 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 JAM3Q9BX67 310 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 UBQLN3Q9H347 655 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 C2orf42Q9NWW7 574 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 NCDNQ9UBB6 729 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ICKQ9UPZ9 632 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 USP3Q9Y6I4 520 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 RLFQ13129 1914 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 KAT6AQ92794 2004 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A0D9SG52 128 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SMCO3A2RU48 225 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 OR4F21O95013 312 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 PTHP01270 115 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 PMP2P02689 132 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CPN1P15169 458 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 PGAM1P18669 254 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 GGT1P19440 569 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 MAGEA3P43357 314 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC11A2P49281 568 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 WNT4P56705 351 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 RAC3P60763 192 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 DYNLT1P63172 113 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SIGLEC14Q08ET2 396 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ST3GAL4Q11206 333 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SCGB2A2Q13296 93 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 HTR4Q13639 388 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 VEZF1Q14119 521 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ST3GAL2Q16842 350 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 DUOXA1Q1HG43 343 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 IDNKQ5T6J7 187 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 NKAIN2Q5VXU1 208 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC22A10Q63ZE4 541 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 LHX8Q68G74 356 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 OR4F3Q6IEY1 312 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CD300LGQ6UXG3 332 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CD163Q86VB7 1156 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 BAP18Q8IXM2 172 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 DAW1Q8N136 415 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ACBD7Q8N6N7 88 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 FBXL13Q8NEE6 735 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 OR1J4Q8NGS1 313 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 BADQ92934 168 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CMBLQ96DG6 245 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 MOCOSQ96EN8 888 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 RNF2Q99496 336 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms