RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 OR5B2Q96R09 309 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 MAGT1Q9H0U3 335 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 FN3KRPQ9HA64 309 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 ARMCX1Q9P291 453 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa3.65□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC169A6NNP5 214 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 AP3B1O00203 1094 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 VENTXO95231 258 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 GJB5O95377 273 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF883P0CG24 379 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 PNMTP11086 282 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 HMGCLP35914 325 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 HMGCS2P54868 508 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 TIGITQ495A1 244 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC183Q5T5S1 534 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 SERPINA9Q86WD7 417 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 OR2T33Q8NG76 320 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 OR5D13Q8NGL4 314 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 VN1R17PQ8TDU5 208 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 TUBGCP3Q96CW5 907 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 CNDP1Q96KN2 507 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC39A3Q9BRY0 314 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 GON7Q9BXV9 100 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC17A5Q9NRA2 495 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 KLK13Q9UKR3 277 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 CDH9Q9ULB4 789 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM220BPB1ANY3 271 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 E9PAM4 449 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 PI15O43692 258 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 HPP00738 406 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 PIGRP01833 764 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 TPM2P07951 284 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 LAMP1P11279 417 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 ACADSP16219 412 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 PCMT1P22061 227 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 IDSP22304 550 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 MMP11P24347 488 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 CD80P33681 288 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 P2RY1P47900 373 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 RPL34P49207 117 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 CASP4P49662 377 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 VLDLRP98155 873 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 ST3GAL3Q11203 375 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 WSCD1Q658N2 575 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF600Q6ZNG1 722 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 CSNK1A1LQ8N752 337 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 OR51G2Q8NGK0 314 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 RASL10AQ92737 203 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 BADQ92934 168 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 TOMM40LQ969M1 308 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 NT5C3BQ969T7 300 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP1R16AQ96I34 528 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 CITED1Q99966 193 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 LRRN3Q9H3W5 708 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 NMRK1Q9NWW6 199 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 HYPKQ9NX55 129 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 CLEC5AQ9NY25 188 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 L3MBTL1Q9Y468 752 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 USP16Q9Y5T5 823 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 KANK1Q14678 1352 aa3.63□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A0U1RQS6 177 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 XKRY2A2RUG3 117 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 LRP5LA4QPB2 252 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 EFCAB7A8K855 629 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 PP2D1A8MPX8 630 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 H0Y8G0 127 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 H3BMQ9 156 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF253O75346 499 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC2A10O95528 541 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 HSMCR30P0CW71 290 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 POU2F1P14859 743 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP3.62□□□□□ -1.833e-28■□□□□ 10.7
RABGGTB-207ENST00000470201 NF2P35240 595 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 CCT3P49368 545 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNJ11Q14654 390 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 PHYHD1Q5SRE7 291 aa3.62□□□□□ -1.83
RABGGTB-207ENST00000470201 BEND3Q5T5X7 828 aa3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms