RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		11.32	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	TRIM2	Q9C040	744 aa		11.32	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		11.32	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	RASSF1	Q9NS23	344 aa		11.32	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		11.32	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	NCDN	Q9UBB6	729 aa		11.32	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	AASS	Q9UDR5	926 aa		11.32	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		11.32	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A0B4J2E0	115 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A1B0GWA3	101 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A1B0GX12	115 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	CHP2	O43745	196 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	TSPAN2	O60636	221 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM20B	O75063	409 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	ADAM11	O75078	769 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	ICOSLG	O75144	302 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	CCDC159	P0C7I6	412 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	UBL4A	P11441	157 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	PTN	P21246	168 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	GPR4	P46093	362 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	CLDN6	P56747	220 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC26A5	P58743	744 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	COX10	Q12887	443 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	TSPAN31	Q12999	210 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	NCF4	Q15080	339 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	ISX	Q2M1V0	245 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	NADK2	Q4G0N4	442 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	BROX	Q5VW32	411 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	HSDL2	Q6YN16	418 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	CADM2	Q8N3J6	435 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	C8orf44	Q96CB5	159 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	ADO	Q96SZ5	270 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	GPA33	Q99795	319 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	CNIH4	Q9P003	139 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	PISD	Q9UG56	409 aa		11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	MUC3A	Q02505	3323 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435		M0R129	80 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	XPNPEP2	O43895	674 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	STK17B	O94768	372 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	LINGO3	P0C6S8	592 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	JMJD7	P0C870	316 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	TBXA2R	P21731	343 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	FPR3	P25089	353 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	ABCD3	P28288	659 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	ADH7	P40394	386 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	ALDH3B2	P48448	385 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	NRG3	P56975	720 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	CXCR4	P61073	352 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	TEK	Q02763	1124 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	TCF15	Q12870	199 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	CD226	Q15762	336 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	C12orf73	Q69YU5	71 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	P3H2	Q8IVL5	708 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	AMER2	Q8N7J2	671 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	PRSS33	Q8NF86	280 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	NUBPL	Q8TB37	319 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM239	Q8WW34	195 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	UBE2F	Q969M7	185 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	TP53INP1	Q96A56	240 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	TAAR9	Q96RI9	348 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	ZPBP	Q9BS86	351 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	DDA1	Q9BW61	102 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	DSN1	Q9H410	356 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	SCN3B	Q9NY72	215 aa		11.3	□□□□□ -0.6
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		11.3	□□□□□ -0.6

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