RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 FOPNLQ96NB1 174 aa3.53□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 PKP4Q99569 1192 aa3.53□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC6A7Q99884 636 aa3.53□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 C19orf43Q9BQ61 176 aa3.53□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 MACROD1Q9BQ69 325 aa3.53□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 TRMOQ9BU70 441 aa3.53□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 TSSK1BQ9BXA7 367 aa3.53□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 ITPAQ9BY32 194 aa3.53□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 GHITMQ9H3K2 345 aa3.53□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 MUC13Q9H3R2 512 aa3.53□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 RSPH14Q9UHP6 348 aa3.53□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
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ECHDC1-211ENST00000460558 MAN1B1Q9UKM7 699 aa3.53□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 MMACHCQ9Y4U1 282 aa3.53□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
ECHDC1-211ENST00000460558 PRSS21Q9Y6M0 314 aa3.53□□□□□ -1.84
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ECHDC1-211ENST00000460558 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 G3V4G9 280 aa3.52□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 TP53I11O14683 189 aa3.52□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 TSPAN4O14817 238 aa3.52□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 LRATO95237 230 aa3.52□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 IFNA16P05015 189 aa3.52□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 CD48P09326 243 aa3.52□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 ERGP11308 486 aa3.52□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 TCF4P15884 667 aa3.52□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 ALOX12P18054 663 aa3.52□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 MDKP21741 143 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 PPP2R1BP30154 601 aa3.52□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 BSGP35613 385 aa3.52□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 MPP3Q13368 585 aa3.52□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 MORN4Q8NDC4 146 aa3.52□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 OR14A16Q8NHC5 309 aa3.52□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 OR14L1PQ8NHC6 308 aa3.52□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 C2CD4CQ8TF44 421 aa3.52□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC13A3Q8WWT9 602 aa3.52□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM186Q96B77 213 aa3.52□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 RILPQ96NA2 401 aa3.52□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 CITED1Q99966 193 aa3.52□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 DHRS9Q9BPW9 319 aa3.52□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF670Q9BS34 389 aa3.52□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 HDHD5Q9BXW7 423 aa3.52□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 OR8D2Q9GZM6 311 aa3.52□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 CTDSP1Q9GZU7 261 aa3.52□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM184CQ9NVA4 438 aa3.52□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 HIF1ANQ9NWT6 349 aa3.52□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 HEY2Q9UBP5 337 aa3.52□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 COPS7AQ9UBW8 275 aa3.52□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 POU2F3Q9UKI9 436 aa3.52□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 MMP24Q9Y5R2 645 aa3.52□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 PSAT1Q9Y617 370 aa3.52□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 LCE6AA0A183 80 aa3.51□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 DPRXA6NFQ7 191 aa3.51□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa3.51□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 MCIDASD6RGH6 385 aa3.51□□□□□ -1.85
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