RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	CD8B	P10966	210 aa		15.91	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	RAC1	P63000	192 aa		15.91	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM27E3	Q08E93	113 aa		15.91	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	15.91	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	POU4F3	Q15319	338 aa		15.91	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	15.91	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	POC1B	Q8TC44	478 aa		15.91	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	MOAP1	Q96BY2	351 aa		15.91	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	DUSP26	Q9BV47	211 aa		15.91	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		15.91	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	STOML1	Q9UBI4	398 aa		15.91	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	HAO1	Q9UJM8	370 aa		15.91	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		15.91	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	ADAMDEC1	O15204	470 aa		15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	TM9SF1	O15321	606 aa		15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	LINGO3	P0C6S8	592 aa		15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	FCGR2A	P12318	317 aa		15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	HPGD	P15428	266 aa		15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	CCKAR	P32238	428 aa		15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	CPOX	P36551	454 aa		15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	CD79B	P40259	229 aa		15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	HBA1	P69905	142 aa		15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	SIRPA	P78324	504 aa		15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	TP53BP2	Q13625	1128 aa		15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	FGFBP1	Q14512	234 aa		15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	CHI3L2	Q15782	390 aa		15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	KLHL26	Q53HC5	615 aa		15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	DCST2	Q5T1A1	773 aa		15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	SORT1	Q99523	831 aa		15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	15.9	■□□□□ 0.14
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR91	A4D1P6	747 aa		15.89	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	15.89	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	15.89	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	KRT16	P08779	473 aa		15.89	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	15.89	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC6A8	P48029	635 aa		15.89	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	15.89	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF117	Q03924	483 aa		15.89	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	SGCB	Q16585	318 aa		15.89	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	15.89	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		15.89	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		15.89	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	P3H2	Q8IVL5	708 aa		15.89	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		15.89	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	OR10D3	Q8NH80	312 aa		15.89	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF145	Q96MT1	663 aa		15.89	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		15.89	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		15.89	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	15.89	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		15.89	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		15.89	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ATR	Q13535	2644 aa		15.89	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		15.88	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		15.88	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	15.88	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	CASK	O14936	926 aa		15.88	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	NPIPA8	P0DM63	369 aa		15.88	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	NID1	P14543	1247 aa		15.88	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP6V1C1	P21283	382 aa		15.88	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	UGT2B10	P36537	528 aa		15.88	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	MPP2	Q14168	576 aa		15.88	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	15.88	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738		Q5PR19	223 aa		15.88	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	CBLN3	Q6UW01	205 aa		15.88	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		15.88	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		15.88	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		15.88	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		15.88	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	15.88	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		15.88	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	OR7D2	Q96RA2	312 aa		15.88	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	PIP5K1A	Q99755	562 aa		15.88	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		15.88	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		15.88	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ZAN	Q9Y493	2812 aa		15.88	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A0J9YW62	118 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	CFLAR	O15519	480 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	SIAH2	O43255	324 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	OIP5	O43482	229 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	SCN2B	O60939	215 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	MYZAP	P0CAP1	466 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	POU2F1	P14859	743 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	IL11	P20809	199 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ELK4	P28324	431 aa		15.87	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ADH6	P28332	368 aa		15.87	■□□□□ 0.13

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