RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SYNGR4O95473 234 aa14.63□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLGP00747 810 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UBL4AP11441 157 aa14.63□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CASP9P55211 416 aa14.63□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SORDQ00796 357 aa14.63□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OCRLQ01968 901 aa14.63□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF117Q03924 483 aa14.63□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FGFBP1Q14512 234 aa14.63□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KLHL26Q53HC5 615 aa14.63□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 POMZP3Q6PJE2 187 aa14.63□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HDXQ7Z353 690 aa14.63□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM222BQ8WU58 562 aa14.63□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 XAGE5Q8WWM1 108 aa14.63□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARL8AQ96BM9 186 aa14.63□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa14.63□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SDF2Q99470 211 aa14.63□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BTNL2Q9UIR0 455 aa14.63□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa14.63□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CARD8Q9Y2G2 431 aa14.63□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 A0A1W2PNV4 684 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GJE1A6NN92 205 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 H0YC42 278 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF264O43296 627 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC22A3O75751 556 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PGRP06401 933 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR12D1P0DN82 309 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RAC1P63000 192 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SIRPAP78324 504 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GSTA3Q16772 222 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM44Q2T9K0 475 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GPAT3Q53EU6 434 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PDZK1Q5T2W1 519 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF621Q6ZSS3 439 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDH24Q86UP0 819 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 METTL25Q8N6Q8 603 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FNDC9Q8TBE3 224 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MIPOL1Q8TD10 442 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FIG4Q92562 907 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC115Q96NT0 180 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NMUR2Q9GZQ4 415 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM185BQ9H7F4 350 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CRIM1Q9NZV1 1036 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 WDR45Q9Y484 360 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GPR45Q9Y5Y3 372 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CELSR2Q9HCU4 2923 aa14.62□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC154A6NI56 674 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C9JVG2 144 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UBDO15205 165 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SCN2BO60939 215 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANP32DO95626 131 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CSTAP01040 98 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IL6P05231 212 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ELK4P28324 431 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KCNJ5P48544 419 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KRTAP10-9P60411 292 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 STX1BP61266 288 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FOXF1Q12946 379 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CBFBQ13951 182 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SAXO2Q658L1 398 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HBMQ6B0K9 141 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LILRA2Q8N149 483 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR10D3Q8NH80 312 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RAB8BQ92930 207 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ROPN1LQ96C74 230 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NEURL3Q96EH8 262 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MARK4Q96L34 752 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SERHL2Q9H4I8 314 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RMND5AQ9H871 391 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RNF122Q9H9V4 155 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TIGARQ9NQ88 270 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 POLE3Q9NRF9 147 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GALNT8Q9NY28 637 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 JKAMPQ9P055 326 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MKLN1Q9UL63 735 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EMC9Q9Y3B6 208 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa14.61□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SERINC4A6NH21 518 aa14.6□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RFXANKO14593 260 aa14.6□□□□□ -0.07
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TNFSF11O14788 317 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms