RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 UBQLN4Q9NRR5 601 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAV18A0A075B6X5 111 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAV27A0A087WT01 109 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 RFXAPO00287 272 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ALPLP05186 524 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 RPL34P49207 117 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ACTBP60709 375 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ACTG1P63261 375 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 MYADMQ96S97 322 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 FOLH1BQ9HBA9 442 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 PGGHGQ32M88 737 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEFF1Q8IYR6 380 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 IL17RCQ8NAC3 791 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR148Q8TDV2 347 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 NAT6Q93015 286 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 FN3KQ9H479 309 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 EVA1AQ9H8M9 152 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 MLXQ9UH92 298 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 HMX2A2RU54 273 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 GGT3PA6NGU5 568 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 FTCDNL1E5RQL4 147 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 PTTG1O95997 202 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 FURINP09958 794 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 THBS2P35442 1172 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 TNFRSF17Q02223 184 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 TCTN2Q96GX1 697 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 MS4A8Q9BY19 250 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 CUTCQ9NTM9 273 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 PHIPQ8WWQ0 1821 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 H7C417 338 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD28O15084 1053 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 TAPBPO15533 448 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF28P17035 718 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 OR7A5Q15622 319 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 AWAT2Q6E213 333 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 FBXO45P0C2W1 286 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 IRS1P35568 1242 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 OR1D4P47884 311 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 C3orf33Q6P1S2 294 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM163Q8TC26 289 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC38A5Q8WUX1 472 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ENY2Q9NPA8 101 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 INIPQ9NRY2 104 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 COPZ2Q9P299 210 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 COL18A1P39060 1754 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM225BP0DP42 221 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 GIPRP48546 466 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 FNTBP49356 437 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 PGFP49763 221 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 SNU13P55769 128 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM52BQ4KMG9 183 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM207Q6UWW9 146 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM30AQ9NV96 361 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNS2Q9ULS6 477 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM183AA6NL82 134 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 SULT2B1O00204 365 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 OR7A10O76100 309 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 GYPBP06028 91 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 MMP2P08253 660 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 IL7P13232 177 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC22A10Q63ZE4 541 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 RAD1O60671 282 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB38P57729 211 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 REEP5Q00765 189 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 RSU1Q15404 277 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 WBP2NLQ6ICG8 309 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 TLDC1Q6P9B6 456 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF595Q8IYB9 648 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 MFSD8Q8NHS3 518 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM174AQ8TBP5 190 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 AQP9O43315 295 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 BCL7AQ4VC05 210 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 INTS14Q96SY0 518 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 IL37Q9NZH6 218 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF337Q9Y3M9 751 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 GLI3P10071 1580 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 CDC14CA4D256 554 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 F5H0A9 414 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 MEN1O00255 615 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 NARSO43776 548 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms