RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A1B0GTH9 108 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A1B0GX78 115 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HYKKA2RU49 373 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VSTM2BA6NLU5 285 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SGK494L7N484 410 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 M0QX08 132 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PDLIM1O00151 329 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CHST10O43529 356 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLOD3O60568 738 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RDH16O75452 317 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MFN2O95140 757 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AGR2O95994 175 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ALPLP05186 524 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FABP3P05413 133 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC35E2P0CK97 266 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C8orf89P0DMQ9 161 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RNH1P13489 461 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF23P17027 643 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CD247P20963 164 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MC3RP41968 323 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ALDH3A2P51648 485 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARSFP54793 590 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CASP9P55211 416 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VLDLRP98155 873 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BIKQ13323 160 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DAG1Q14118 895 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GNA13Q14344 377 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GK3PQ14409 553 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GRM7Q14831 915 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NRF1Q16656 503 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IFI44LQ53G44 452 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AP1ARQ63HQ0 302 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FCRLBQ6BAA4 426 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPINK14Q6IE38 97 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR2T5Q6IEZ7 315 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM107Q6UX40 140 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VTCN1Q7Z7D3 282 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GALNT10Q86SR1 603 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HIPK1Q86Z02 1210 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LIX1LQ8IVB5 337 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF595Q8IYB9 648 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM52Q8NDY8 209 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NUP43Q8NFH3 380 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR5T3Q8NGG3 340 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR9A4Q8NGU2 314 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR2T29Q8NH02 315 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RASSF5Q8WWW0 418 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LZICQ8WZA0 190 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TFAP2CQ92754 450 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CTHRC1Q96CG8 243 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM19Q96HH6 336 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF347Q96SE7 839 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BTBD2Q9BX70 525 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACTRT3Q9BYD9 372 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANKRD60Q9BZ19 345 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C3orf18Q9UK00 162 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LIPT1Q9Y234 373 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAU2Q9Y6X3 613 aa8.73□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SCN3AQ9NY46 2000 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A0G2JPF8 293 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAGEA13PA6NCF6 341 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM247A6NEH6 219 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF860A6NHJ4 632 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DUXAA6NLW8 204 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C5orf58C9J3I9 102 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 G3V2T6 193 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 H0YAE9 185 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 I3L1I5 382 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EI24O14681 340 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FGF17O60258 216 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CTNSO60931 367 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SOX30O94993 753 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ONECUT2O95948 504 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BCHEP06276 602 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR12D1P0DN82 309 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ETS2P15036 469 aa8.72□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ITGA2P17301 1181 aa8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms