RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409148.1

LRRTM1-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 4 BASIC

Gene LRRTM1, Length 2,126 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1-202ENST00000409148 ZSWIM7Q19AV6 140 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 PDZK1Q5T2W1 519 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 CDK20Q8IZL9 346 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 ZNF614Q8N883 585 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 RNF167Q9H6Y7 350 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 Q9N2J8 555 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 CFL2Q9Y281 166 aa15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 EYSQ5T1H1 3165 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 KNL1Q8NG31 2342 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 FITM1A5D6W6 292 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 CDC42EP2O14613 210 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 DSCR3O14972 297 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 SDC3O75056 442 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 LYPD3O95274 346 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 CH25HO95992 272 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 HBQ1P09105 142 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 IFI30P13284 250 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 ETV5P41161 510 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 GCGRP47871 477 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 ETV1P50549 477 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 CDH11P55287 796 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 BTG2P78543 158 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 PRKCDQ05655 676 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 DOC2BQ14184 412 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 ERV3-1Q14264 604 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 GRM7Q14831 915 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 SIX5Q8N196 739 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 OR52L1Q8NGH7 329 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 C1orf216Q8TAB5 229 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 SAMD8Q96LT4 415 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 HS6ST2Q96MM7 605 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 NDUFB11Q9NX14 153 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 MED31Q9Y3C7 131 aa15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 TMEM129A0AVI4 362 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 PIAS2O75928 621 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 GAS1P54826 345 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 WNT4P56705 351 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 BIKQ13323 160 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 AMZ1Q400G9 498 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 PAQR6Q6TCH4 344 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 WDR88Q6ZMY6 472 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 OR51Q1Q8NH59 317 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 FANK1Q8TC84 345 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 G6PC3Q9BUM1 346 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 CNPPD1Q9BV87 410 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 DPH1Q9BZG8 443 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 OR52D1Q9H346 318 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 STUB1Q9UNE7 303 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 CEP192Q8TEP8 1941 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 GON4LQ3T8J9 2241 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 NDUFB5O43674 189 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 GPX5O75715 221 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 PTNP21246 168 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 MAOAP21397 527 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 GALNSP34059 522 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 GPR3P46089 330 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 TPTEP56180 551 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 IFITM2Q01629 132 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 SERTAD2Q14140 314 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 AADACL4Q5VUY2 407 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 TUBA3EQ6PEY2 450 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 PFN4Q8NHR9 129 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 CLDN16Q9Y5I7 305 aa15.92■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 HRKO00198 91 aa15.91■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 CHP2O43745 196 aa15.91■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 IGKV1D-16P01601 117 aa15.91■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 IFNA16P05015 189 aa15.91■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 IL9P15248 144 aa15.91■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 BMP7P18075 431 aa15.91■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 S100A5P33763 92 aa15.91■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 PLAURQ03405 335 aa15.91■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 DNASE1L3Q13609 305 aa15.91■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 NXNL2Q5VZ03 156 aa15.91■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 HSDL2Q6YN16 418 aa15.91■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa15.91■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 SNX29P2Q8IUI4 249 aa15.91■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 CARFQ8N187 725 aa15.91■□□□□ 0.14
LRRTM1-202ENST00000409148 OR4N2Q8NGD1 307 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms