RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 EGR1P18146 543 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 GGT1P19440 569 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 ENPP1P22413 925 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 TYK2P29597 1187 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 NR4A2P43354 598 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 BHLHB9Q6PI77 547 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM108Q6UXF1 575 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 ELP4Q96EB1 424 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 PSD2Q9BQI7 771 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 COQ10BQ9H8M1 238 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 C3orf14Q9HBI5 128 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 MGAT4BQ9UQ53 548 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 PLCE1Q9P212 2302 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 OR5H1A6NKK0 313 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 SMIM24O75264 130 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 HSD3B1P14060 373 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 HSD3B2P26439 372 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP16.98■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 STX2P32856 288 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF83P51522 516 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 C2orf80Q0P641 193 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 FOXF1Q12946 379 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 CALCOCO2Q13137 446 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 NAB1Q13506 487 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 SLC29A2Q14542 456 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 ZAR1Q86SH2 424 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 SOX7Q9BT81 388 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 ACPTQ9BZG2 426 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 BCO1Q9HAY6 547 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 TMCO1Q9UM00 188 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 TENM1Q9UKZ4 2725 aa16.98■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 ESYT3A0FGR9 886 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC188H7C350 402 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 SLITRK5O94991 958 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 RBP1P09455 135 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 DHRS4L1P0CG22 281 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 COX5AP20674 150 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 DDCP20711 480 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 CD40P25942 277 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 PRIM2P49643 509 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 PDLIM4P50479 330 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 BTKQ06187 659 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 P2RY8Q86VZ1 359 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 DEPDC4Q8N2C3 294 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 OR52N5Q8NH56 324 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 FAM110BQ8TC76 370 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 GPR151Q8TDV0 419 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 EQTNQ9NQ60 294 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 GRHL1Q9NZI5 618 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PR80 420 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF195O14628 629 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 NGFRP08138 427 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 PTAFRP25105 342 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 MAP3K8P41279 467 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 MAGEA4P43358 317 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 HTR6P50406 440 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 SERPINB8P50452 374 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 ACSM2AQ08AH3 577 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 TRADDQ15628 312 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 ACSM2BQ68CK6 577 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF544Q6NX49 715 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 SLC43A2Q8N370 569 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 CDC26Q8NHZ8 85 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 FBXO27Q8NI29 283 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 FOXN4Q96NZ1 517 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 PIMREGQ9BSJ6 248 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 INPP5KQ9BT40 448 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 GRID1Q9ULK0 1009 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 SLC25A15Q9Y619 301 aa16.96■□□□□ 0.31
HOXD12-201ENST00000404162 RGS14O43566 566 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXD12-201ENST00000404162 RAD51DO75771 328 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXD12-201ENST00000404162 NKX2-2O95096 273 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXD12-201ENST00000404162 KRT6AP02538 564 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXD12-201ENST00000404162 KRT6BP04259 564 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXD12-201ENST00000404162 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
HOXD12-201ENST00000404162 HSD17B3P37058 310 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXD12-201ENST00000404162 KRT6CP48668 564 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXD12-201ENST00000404162 CHRNEQ04844 493 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXD12-201ENST00000404162 CHRNB3Q05901 458 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXD12-201ENST00000404162 CD226Q15762 336 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXD12-201ENST00000404162 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
HOXD12-201ENST00000404162 SPIN4Q56A73 249 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXD12-201ENST00000404162 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
HOXD12-201ENST00000404162 GALNT18Q6P9A2 607 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXD12-201ENST00000404162 SSX8Q7RTT4 187 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXD12-201ENST00000404162 ZFP90Q8TF47 636 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
HOXD12-201ENST00000404162 AMDHD1Q96NU7 426 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXD12-201ENST00000404162 ERP44Q9BS26 406 aa16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms