RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 FRS3O43559 492 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 MMP2P08253 660 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 NKPD1Q17RQ9 610 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ESCO2Q56NI9 601 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 PRRT3Q5FWE3 981 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 DCST2Q5T1A1 773 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SLC22A25Q6T423 547 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SGPP2Q8IWX5 399 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 PIANPQ8IYJ0 282 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 OR13C3Q8NGS6 347 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 GGHQ92820 318 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SPTSSAQ969W0 71 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SAMD8Q96LT4 415 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 NME7Q9Y5B8 376 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF254O75437 659 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 P04436 131 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CYBAP13498 195 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 TYRP14679 529 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SDC1P18827 310 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 FBLP22087 321 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 TNFSF4P23510 183 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CERS1P27544 350 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CXCR4P61073 352 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 GRM2Q14416 872 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 HYAL4Q2M3T9 481 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 DEFB134Q4QY38 66 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 RTP2Q5QGT7 225 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 KCTD11Q693B1 232 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 FRMPD2BQ6IN97 320 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 FIGNL1Q6PIW4 674 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ESX1Q8N693 406 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 TERB2Q8NHR7 220 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CD200R1Q8TD46 325 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 MUL1Q969V5 352 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 MS4A4AQ96JQ5 239 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 UBXN10Q96LJ8 280 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 WDR92Q96MX6 357 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CLDND1Q9NY35 253 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 FEZF1A0PJY2 475 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 AIPO00170 330 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 LEFTY1O75610 366 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CAMK2DQ13557 499 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 PCGF3Q3KNV8 242 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 METTL11BQ5VVY1 283 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 OR4N5Q8IXE1 308 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 OR9A2Q8NGT5 310 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 GORASP2Q9H8Y8 452 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM45AQ9NWC5 275 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 GLTPQ9NZD2 209 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 TOR1AO14656 332 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 JRKO75564 520 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 RPS17P08708 135 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 BDKRB2P30411 391 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 RAB28P51157 221 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 LY6G5CQ5SRR4 150 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 NADSYN1Q6IA69 706 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 MAVSQ7Z434 540 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 TBC1D20Q96BZ9 403 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SAMD11Q96NU1 681 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ALG8Q9BVK2 526 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 PPA2Q9H2U2 334 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CERS4Q9HA82 394 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 A0A087WUU8 490 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 LEFTY2O00292 366 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ARNTLO00327 626 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM225BP0DP42 221 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 PRSS3P35030 304 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 FCRLBQ6BAA4 426 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF695Q8IW36 515 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 FRZBQ92765 325 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 DRGXA6NNA5 263 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 A8MVJ9 347 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 FAM171A2A8MVW0 826 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 TGM5O43548 720 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 GLSO94925 669 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SYPP08247 313 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SMIM18P0DKX4 95 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 BPIP17213 487 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 RPS21P63220 83 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 LMAN2Q12907 356 aa8.36□□□□□ -1.07
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