RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-208ENST00000392449 SERPINB4P48594 390 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-208ENST00000392449 CCT3P49368 545 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-208ENST00000392449 RPS26P62854 115 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-208ENST00000392449 RAC1P63000 192 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-208ENST00000392449 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-208ENST00000392449 SPDYE7PQ495Y7 208 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-208ENST00000392449 HBMQ6B0K9 141 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-208ENST00000392449 CDC73Q6P1J9 531 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-208ENST00000392449 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-208ENST00000392449 OLIG3Q7RTU3 272 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-208ENST00000392449 CLEC4FQ8N1N0 589 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-208ENST00000392449 OR5D16Q8NGK9 328 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-208ENST00000392449 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-208ENST00000392449 ACTRT2Q8TDY3 377 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-208ENST00000392449 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.036e-7■■□□□ 14
PTPRK-208ENST00000392449 ROBO4Q8WZ75 1007 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-208ENST00000392449 C12orf49Q9H741 205 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-208ENST00000392449 DUSP22Q9NRW4 184 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-208ENST00000392449 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-208ENST00000392449 CARD8Q9Y2G2 431 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-208ENST00000392449 EMC9Q9Y3B6 208 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-208ENST00000392449 V9GYY5 206 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-208ENST00000392449 NAV3Q8IVL0 2385 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 A0A1W2PQD3 144 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 BPGMP07738 259 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 MAPK1P28482 360 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 PCYT1AP49585 367 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 CTBP2P56545 445 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 OCRLQ01968 901 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 FGFBP1Q14512 234 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 DCST2Q5T1A1 773 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 STAC2Q6ZMT1 411 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 LILRA2Q8N149 483 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 OR6K3Q8NGY3 331 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 OR5P2Q8WZ92 322 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 TUBGCP3Q96CW5 907 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 STACQ99469 402 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 ACTRT3Q9BYD9 372 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 SRXN1Q9BYN0 137 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 ROS1P08922 2347 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 DSCAMO60469 2012 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 ARID1AO14497 2285 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 ITM2AO43736 263 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 TYROBPO43914 113 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 SYNGR4O95473 234 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 NUDT14O95848 222 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 G6PDP11413 515 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 ATP6V1C1P21283 382 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 ME2P23368 584 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 SOAT1P35610 550 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 KLHL26Q53HC5 615 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 Q5PR19 223 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 MISPQ8IVT2 679 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 RIMKLAQ8IXN7 391 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 CLECL1Q8IZS7 167 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF614Q8N883 585 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 PSMA8Q8TAA3 256 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 ADAMTS15Q8TE58 950 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 ABHD3Q8WU67 409 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 OSTF1Q92882 214 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 COQ8BQ96D53 544 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 KLHL15Q96M94 604 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 SERHL2Q9H4I8 314 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 STOML1Q9UBI4 398 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 WDR91A4D1P6 747 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 CFLARO15519 480 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 PLAUP00749 431 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 FOSL1P15407 271 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 AGTR1P30556 359 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 LCN1P31025 176 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 RPL3P39023 403 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 ETV4P43268 484 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 CASP9P55211 416 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 HBA1P69905 142 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 ACKR1Q16570 336 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 PGS1Q32NB8 556 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 OR56A1Q8NGH5 318 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 RFWD2Q8NHY2 731 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 FBXO27Q8NI29 283 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 PERPQ96FX8 193 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 C18orf12Q96KH6 178 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 OR7D2Q96RA2 312 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 CCL19Q99731 98 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 ICAM5Q9UMF0 924 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 SMPD2O60906 423 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 NID1P14543 1247 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 CARD18P57730 90 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-208ENST00000392449 TSC22D1Q15714 1073 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms