RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371219.2

RBM38-204, Transcript of RNA binding motif protein 38, human

TSL 2 BASIC

Gene RBM38, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM38-204	ENST00000371219	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	OR10A6	Q8NH74	314 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	NFKBID	Q8NI38	313 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	ARSG	Q96EG1	525 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	LAT2	Q9GZY6	243 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	DKKL1	Q9UK85	242 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	FAAH	O00519	579 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	HCRTR2	O43614	444 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	CSTA	P01040	98 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	NPIPA8	P0DM63	369 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	UQCRB	P14927	111 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	DPP4	P27487	766 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	PRKAR1B	P31321	381 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	PGM1	P36871	562 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	P2RX1	P51575	399 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF117	Q03924	483 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	CBFB	Q13951	182 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	MAPK14	Q16539	360 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	IFNE	Q86WN2	208 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	OR2T12	Q8NG77	320 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	RELN	P78509	3460 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	CDHR4	A6H8M9	788 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	BCKDK	O14874	412 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	CBX6	O95503	412 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	ACTL6A	O96019	429 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	CHM	P24386	653 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	ELK4	P28324	431 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	ADH6	P28332	368 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	SLC7A2	P52569	658 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	DLX5	P56178	289 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	PSME3	P61289	254 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	AAGAB	Q6PD74	315 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	CCDC80	Q76M96	950 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	OR5W2	Q8NH69	310 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	SARAF	Q96BY9	339 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	NSL1	Q96IY1	281 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF583	Q96ND8	569 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	C1orf21	Q9H246	121 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	DSN1	Q9H410	356 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	ALG2	Q9H553	416 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBM38-204	ENST00000371219	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		13.4	□□□□□ -0.27
RBM38-204	ENST00000371219	MPDZ	O75970	2070 aa		13.4	□□□□□ -0.27
RBM38-204	ENST00000371219	MED12	Q93074	2177 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM38-204	ENST00000371219	FLNC	Q14315	2725 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM38-204	ENST00000371219	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM38-204	ENST00000371219		B4DXG7	233 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM38-204	ENST00000371219	SYT5	O00445	386 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM38-204	ENST00000371219	NME4	O00746	187 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM38-204	ENST00000371219	TRAPPC6A	O75865	159 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM38-204	ENST00000371219	IFNA14	P01570	189 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM38-204	ENST00000371219	PGC	P20142	388 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM38-204	ENST00000371219	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RBM38-204	ENST00000371219	TOMM20	Q15388	145 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM38-204	ENST00000371219	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM38-204	ENST00000371219	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM38-204	ENST00000371219	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RBM38-204	ENST00000371219	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RBM38-204	ENST00000371219	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RBM38-204	ENST00000371219	EID3	Q8N140	333 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM38-204	ENST00000371219	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RBM38-204	ENST00000371219	GATS	Q8NAP1	163 aa		13.39	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms