RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 STX7O15400 261 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 B3GAT3O94766 335 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 MBD3O95983 291 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 ACTL6AO96019 429 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 IGLV1-47P01700 117 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 OPN1LWP04000 364 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 IGF1P05019 195 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 OR8U8P0C7N1 319 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 CLUP10909 449 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 CYP2F1P24903 491 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 KIF5BP33176 963 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 MAGEA5P43359 124 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 KIR2DS2P43631 304 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 SCGB2A2Q13296 93 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 ASPHD2Q6ICH7 369 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 CBLN3Q6UW01 205 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP1R27Q86WC6 154 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 ZBTB44Q8NCP5 570 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 BBS1Q8NFJ9 593 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 NANPQ8TBE9 248 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 RSPH1Q8WYR4 309 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 NEIL2Q969S2 332 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 MARC2Q969Z3 335 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 AKR1E2Q96JD6 320 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 IMMP1LQ96LU5 166 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 PLEKHF1Q96S99 279 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 CITED1Q99966 193 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 CNPY3Q9BT09 278 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 GSDMCQ9BYG8 508 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 SMC3Q9UQE7 1217 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 CHMP2BQ9UQN3 213 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 SPACA6W5XKT8 324 aa2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A087WZY1 265 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 TUBAL3A6NHL2 446 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 H3BMQ9 156 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 FCN1O00602 326 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 EMC8O43402 210 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 TIMP1P01033 207 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 TNNI3P19429 210 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 SERPINA2P20848 420 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 GCKP35557 465 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 RIPK4P57078 832 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF45Q02386 682 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 LAGE3Q14657 143 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 IL17AQ16552 155 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 MAPK6Q16659 721 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 NDUFA9Q16795 377 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 TIGITQ495A1 244 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC14Q49A88 953 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 DNM1P46Q6ZS02 220 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 OR5B2Q96R09 309 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 NICN1Q9BSH3 213 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 CHIAQ9BZP6 476 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 CALHM2Q9HA72 323 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR45Q9Y484 360 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 MAB21L2Q9Y586 359 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 PANO1I0J062 215 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 F10P00742 488 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 DLSTP36957 453 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 WNT4P56705 351 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 BPIFB3P59826 476 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 HTD2P86397 168 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 HERPUD1Q15011 391 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 CFAP221Q4G0U5 840 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 LCE3AQ5TA76 89 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD49Q8WVL7 239 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 FAHD2AQ96GK7 314 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 SMIM14Q96QK8 99 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 CYP2S1Q96SQ9 504 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF126Q9BV68 326 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 DUSP16Q9BY84 665 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR76Q9H967 626 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 MARCH5Q9NX47 278 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 TAS2R3Q9NYW6 316 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP8B3O60423 1300 aa2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms