RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366672.4

GALNT2-201, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT2, Length 4,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT2-201ENST00000366672 BEX2Q9BXY8 128 aa17.38■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 BEX1Q9HBH7 125 aa17.38■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 ATG4BQ9Y4P1 393 aa17.38■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 TEX46H3BTG2 121 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 ERP29P30040 261 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 NR0B2Q15466 257 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 ZNF683Q8IZ20 524 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 M0R129 80 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 PDX1P52945 283 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 RELAQ04206 551 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 PUDPQ08623 228 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 C1orf53Q5VUE5 145 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 SLC25A25Q6KCM7 469 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 HMBOX1Q6NT76 420 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 DCDC5Q6ZRR9 648 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 FAM217AQ8IXS0 508 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 DNAJC22Q8N4W6 341 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 HRASLS5Q96KN8 279 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 SHROOM3Q8TF72 1996 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 ZNF878C9JN71 531 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 J3KTA2 159 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 ITGA3P26006 1051 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 GRPRP30550 384 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 BCL6P41182 706 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 GNG2P59768 71 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 TSPAN31Q12999 210 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 CDKN3Q16667 212 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 ABCA11PQ4W5N1 156 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 MANEAQ5SRI9 462 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 SLC18B1Q6NT16 456 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 FAM111BQ6SJ93 734 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 DDIT4LQ96D03 193 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 FANCFQ9NPI8 374 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 ASB4Q9Y574 426 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 IFNA21P01568 189 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 IL7P13232 177 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 CHMP24386 653 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 RACK1P63244 317 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 SCRN3Q0VDG4 424 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 C1orf94Q6P1W5 598 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 RHBDD1Q8TEB9 315 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 NXPE2Q96DL1 559 aa17.37■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 CENPBD1B2RD01 187 aa17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 SYT5O00445 386 aa17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 IL33O95760 270 aa17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 OTX2P32243 289 aa17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 SOX3P41225 446 aa17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 ZNF91Q05481 1191 aa17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 OR1Q1Q15612 314 aa17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 SGPP1Q9BX95 441 aa17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 PPT2Q9UMR5 302 aa17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 OR51B4Q9Y5P0 310 aa17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 MAGEA2P43356 314 aa17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 SEMA6CQ9H3T2 930 aa17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 POM121BA6NF01 834 aa17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 APOC1P02654 83 aa17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 CD27P26842 260 aa17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 OR1D4P47884 311 aa17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 ERV3-1Q14264 604 aa17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 COX20Q5RI15 118 aa17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 LAS2Q8IYD9 372 aa17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 OR51Q1Q8NH59 317 aa17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 RHOXF1Q8NHV9 184 aa17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 TMEM246Q9BRR3 403 aa17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 HPF1Q9NWY4 346 aa17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 NLKQ9UBE8 527 aa17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 SH2B3Q9UQQ2 575 aa17.36■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 LRIT2A6NDA9 550 aa17.35■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 GDI2P50395 445 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 TLE3Q04726 772 aa17.35■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 SPCS2Q15005 226 aa17.35■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 PGGHGQ32M88 737 aa17.35■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 PYHIN1Q6K0P9 492 aa17.35■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 SYNPOQ8N3V7 929 aa17.35■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 CLCC1Q96S66 551 aa17.35■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa17.35■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 A4GALTQ9NPC4 353 aa17.35■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 THSD1Q9NS62 852 aa17.35■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 CAPZA1P52907 286 aa17.35■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 LPAL2Q16609 132 aa17.35■□□□□ 0.37
GALNT2-201ENST00000366672 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms