RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 GRB7Q14451 532 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 RTP2Q5QGT7 225 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 MANEAQ5SRI9 462 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 MTFR2Q6P444 385 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM150AQ86TG1 271 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 POGLUT1Q8NBL1 392 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 GALNT11Q8NCW6 608 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 NUDT9Q9BW91 350 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 TXLNGYQ9BZA5 131 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 TUBB1Q9H4B7 451 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF160Q9HCG1 818 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 IL26Q9NPH9 171 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 MYOTQ9UBF9 498 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 PRKACGP22612 351 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 PCGF3Q3KNV8 242 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 GARNL3Q5VVW2 1013 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 OPN5Q6U736 354 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 OR4N5Q8IXE1 308 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 OR56B1Q8NGI3 324 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 OR51T1Q8NGJ9 327 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 MAL2Q969L2 176 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 SNX18Q96RF0 628 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 OBP2AQ9NY56 170 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CACFD1Q9UGQ2 172 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 SCN9AQ15858 1988 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 C12orf71A8MTZ7 269 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 GFRA2O00451 464 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 UBBP0CG47 229 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 GAAP10253 952 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 MAGEA3P43357 314 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 SOX2P48431 317 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 UBA52P62987 128 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 NFATC3Q12968 1075 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 OR8J2Q8NGG1 315 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM239Q8WW34 195 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 NXPE3Q969Y0 559 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ETV7Q9Y603 341 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 SNAPINO95295 136 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ARG2P78540 354 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 PKDCCQ504Y2 493 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 KIAA1211LQ6NV74 962 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 LINC00299Q6ZSB3 139 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 MFSD9Q8NBP5 474 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 OR52B6Q8NGF0 335 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 GPR62Q9BZJ7 368 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 LYSMD4Q5XG99 296 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 OR9K2Q8NGE7 335 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CRYGNQ8WXF5 182 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 RNF186Q9NXI6 227 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 C2orf78A6NCI8 922 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 SULT1C2O00338 296 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CHATP28329 748 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 FASLGP48023 281 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 DUSP7Q16829 419 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 LPCAT3Q6P1A2 487 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 PLBD1Q6P4A8 553 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 LRFN4Q6PJG9 635 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF695Q8IW36 515 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ITFG2Q969R8 447 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 SGIP1Q9BQI5 828 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 HDAC8Q9BY41 377 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 HS3ST2Q9Y278 367 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 MMACHCQ9Y4U1 282 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CLDN24A6NM45 220 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ITGB2P05107 769 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 F3P13726 295 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 IL1RNP18510 177 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CD70P32970 193 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 MADCAM1Q13477 382 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CEACAM7Q14002 265 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF321PQ8N8H1 164 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 NANPQ8TBE9 248 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM163Q8TC26 289 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ASB13Q8WXK3 278 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 SIAEQ9HAT2 523 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 PDLIM7Q9NR12 457 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 NHSQ6T4R5 1651 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 IL3RAP26951 378 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CERS1P27544 350 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 IDUAP35475 653 aa5.66□□□□□ -1.5
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