RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 NDC1Q9BTX1 674 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 SLC28A3Q9HAS3 691 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 PRDM9Q9NQV7 894 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 CMC2Q9NRP2 79 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM5Q9Y2B1 443 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 C5orf67F2Z3F1 127 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 BTN3A3O00478 584 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 IFI30P13284 250 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 MAKP20794 623 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 ACSL1P33121 698 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 THBS2P35442 1172 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 ENPP2Q13822 863 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 C2orf27AQ580R0 203 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 OAFQ86UD1 273 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 PFN4Q8NHR9 129 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 PIGUQ9H490 435 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 ENAMQ9NRM1 1142 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 KCMF1Q9P0J7 381 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 KLF15Q9UIH9 416 aa16.94■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 PLPP2O43688 288 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 PLOD3O60568 738 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 FMO6PO60774 539 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 STX11O75558 287 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 PRG2P13727 222 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 NID1P14543 1247 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 HK1P19367 917 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 FCARP24071 287 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 CAPZA2P47755 286 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 PITPNBP48739 271 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 GPR176Q14439 515 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 OR1Q1Q15612 314 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 KLHL12Q53G59 568 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 CCNJQ5T5M9 372 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 GARNL3Q5VVW2 1013 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 SFXN4Q6P4A7 337 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 ARL9Q6T311 187 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 SAMD12Q8N8I0 201 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 OR7G1Q8NGA0 311 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 OR4E2Q8NGC2 313 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 ZFPM2Q8WW38 1151 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 HCAR1Q9BXC0 346 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 SLC17A9Q9BYT1 436 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 GALNT9Q9HCQ5 603 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 C20orf141Q9NUB4 165 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 CLDND1Q9NY35 253 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 SATB2Q9UPW6 733 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 SCN3AQ9NY46 2000 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1W2PQU0 124 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 FUT1P19526 365 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 NPR2P20594 1047 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 MAPK14Q16539 360 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 DCST2Q5T1A1 773 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 HACD4Q5VWC8 232 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 USP53Q70EK8 1073 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 SLC37A3Q8NCC5 494 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 C17orf50Q8WW18 174 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 ARMC5Q96C12 935 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 APOOQ9BUR5 198 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 TRPV4Q9HBA0 871 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 RASD1Q9Y272 281 aa16.93■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 CDHR4A6H8M9 788 aa16.92■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 HRO43593 1189 aa16.92■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 LYPD3O95274 346 aa16.92■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 CPMP14384 443 aa16.92■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 NDUFS1P28331 727 aa16.92■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 SHC1P29353 583 aa16.92■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 RPS7P62081 194 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 FOXK2Q01167 660 aa16.92■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 BTBD16Q32M84 506 aa16.92■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 PLA1AQ53H76 456 aa16.92■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 IL20RBQ6UXL0 311 aa16.92■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa16.92■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 CREB3L2Q70SY1 520 aa16.92■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 CDK20Q8IZL9 346 aa16.92■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa16.92■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 DEDD2Q8WXF8 326 aa16.92■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 OR2M4Q96R27 311 aa16.92■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 IFT27Q9BW83 186 aa16.92■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 ENKD1Q9H0I2 346 aa16.92■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 FGF22Q9HCT0 170 aa16.92■□□□□ 0.3
SPNS3-201ENST00000355530 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms