RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340958.3

CLDN4-201, Transcript of claudin 4, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN4, Length 1,831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4-201ENST00000340958 TTC23Q5W5X9 447 aa15.95■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 PODNL1Q6PEZ8 512 aa15.95■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF730Q6ZMV8 503 aa15.95■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 NDUFAF7Q7L592 441 aa15.95■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa15.95■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 OR5M3Q8NGP4 307 aa15.95■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 DHRS1Q96LJ7 313 aa15.95■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF559Q9BR84 538 aa15.95■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 SPRY4Q9C004 299 aa15.95■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF160Q9HCG1 818 aa15.95■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 FLRT3Q9NZU0 649 aa15.95■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa15.95■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa15.95■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 C21orf140B9A014 251 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 H0YAE9 185 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 OR5F1O95221 314 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 COX6A1P12074 109 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 PRG2P13727 222 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 TBXA2RP21731 343 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 FUT4P22083 530 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 RYKP34925 604 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 LIMS1P48059 325 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 CCR4P51679 360 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 PNLIPRP2P54317 469 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 OR1Q1Q15612 314 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 FAHD1Q6P587 224 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 KIRREL2Q6UWL6 708 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 OR11G2Q8NGC1 345 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 SLC7A13Q8TCU3 470 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 GPR87Q9BY21 358 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 SELENONQ9NZV5 590 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 SLC7A7Q9UM01 511 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 TRAPPC13A5PLN9 417 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 TSPAN2O60636 221 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 UBL4AP11441 157 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 IFNGR2P38484 337 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 STAT5AP42229 794 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 CLK3P49761 638 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF136P52737 540 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 COPZ1P61923 177 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 KCNAB2Q13303 367 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 EFR3AQ14156 821 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 GDF7Q7Z4P5 450 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 CADM2Q8N3J6 435 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 MARVELD2Q8N4S9 558 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 LINC00471Q8N535 108 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 IL22RA1Q8N6P7 574 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 M1APQ8TC57 530 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 SLC22A8Q8TCC7 542 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 OIT3Q8WWZ8 545 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 ANKRD60Q9BZ19 345 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 FAM118AQ9NWS6 357 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 MYOTQ9UBF9 498 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 POFUT2Q9Y2G5 429 aa15.94■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 SH3PXD2BA1X283 911 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 TRABD2BA6NFA1 517 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 SOCS6O14544 535 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 FMO6PO60774 539 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 UGT2B11O75310 529 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 CLIC3O95833 236 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 GASTP01350 101 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 UGT2B15P54855 530 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 SEC23BQ15437 767 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 NDUFAF6Q330K2 333 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 PLAG1Q6DJT9 500 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF440Q8IYI8 595 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 GRHL3Q8TE85 626 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 TMCO6Q96DC7 493 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 MBOAT4Q96T53 435 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 B3GNT4Q9C0J1 378 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 MGAT4BQ9UQ53 548 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa15.93■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 ARRDC5A6NEK1 342 aa15.92■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 OR6C70A6NIJ9 312 aa15.92■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 NDUFB5O43674 189 aa15.92■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 PPM1BO75688 479 aa15.92■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 OR2J2O76002 312 aa15.92■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 GNAO1P09471 354 aa15.92■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 HTR2AP28223 471 aa15.92■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 TMED10P49755 219 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 DESI1Q6ICB0 168 aa15.92■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa15.92■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CLDN4-201ENST00000340958 OR4K5Q8NGD3 323 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms