RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 ZSWIM7Q19AV6 140 aa24.32■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 EIPR1Q53HC9 387 aa24.32■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 RABL3Q5HYI8 236 aa24.32■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 KRT73Q86Y46 540 aa24.32■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 HIPK4Q8NE63 616 aa24.32■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 OR52P1PQ8NH57 321 aa24.32■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 WDR60Q8WVS4 1066 aa24.32■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 SARAFQ96BY9 339 aa24.32■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 ARMC7Q9H6L4 198 aa24.32■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF835Q9Y2P0 537 aa24.32■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 LIPGQ9Y5X9 500 aa24.32■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 A0A087WZY1 265 aa24.31■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa24.31■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 NID1P14543 1247 aa24.31■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 ABOP16442 354 aa24.31■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 HK1P19367 917 aa24.31■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 GZMMP51124 257 aa24.31■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 MNAT1P51948 309 aa24.31■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 PTOV1Q86YD1 416 aa24.31■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa24.31■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF607Q96SK3 696 aa24.31■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa24.31■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 SLC6A15Q9H2J7 730 aa24.31■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 ARL8BQ9NVJ2 186 aa24.31■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 ICAM5Q9UMF0 924 aa24.31■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 ANGPT4Q9Y264 503 aa24.31■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa24.3■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 BCKDKO14874 412 aa24.3■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 SLC19A2O60779 497 aa24.3■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 THBS1P07996 1170 aa24.3■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 PGM1P36871 562 aa24.3■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 CASP6P55212 293 aa24.3■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 LIN52Q52LA3 116 aa24.3■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 NHSL2Q5HYW2 709 aa24.3■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 IFNEQ86WN2 208 aa24.3■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 CALHM3Q86XJ0 350 aa24.3■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 MED12Q93074 2177 aa24.29■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 LINC01387J3KSC0 135 aa24.29■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 PRRG2O14669 202 aa24.29■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 GMFGO60234 142 aa24.29■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 WISP1O95388 367 aa24.29■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 ACTL6AO96019 429 aa24.29■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 ERICH5Q6P6B1 374 aa24.29■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 AAGABQ6PD74 315 aa24.29■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 CBLN3Q6UW01 205 aa24.29■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 FGD2Q7Z6J4 655 aa24.29■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 HMGN2P46Q86SG4 172 aa24.29■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 ZZZ3Q8IYH5 903 aa24.29■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 OR5W2Q8NH69 310 aa24.29■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 PRR7Q8TB68 274 aa24.29■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 ARSGQ96EG1 525 aa24.29■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF583Q96ND8 569 aa24.29■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 ACAD8Q9UKU7 415 aa24.29■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 OSGIN2Q9Y236 505 aa24.29■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 NPIPA2E9PIF3 369 aa24.28■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 NPIPA3F8WFD2 350 aa24.28■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 SERPINB7O75635 380 aa24.28■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 NUDT14O95848 222 aa24.28■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 CHMP24386 653 aa24.28■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 UQCRFS1P47985 274 aa24.28■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 SKP2Q13309 424 aa24.28■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 CBFBQ13951 182 aa24.28■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 VMACQ2NL98 169 aa24.28■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 SLC15A3Q8IY34 581 aa24.28■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa24.28■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 FAM71CQ8NEG0 241 aa24.28■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 FAM57AQ8TBR7 257 aa24.28■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 NSL1Q96IY1 281 aa24.28■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 PIGQQ9BRB3 760 aa24.28■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 PIF1Q9H611 641 aa24.28■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 SLC6A5Q9Y345 797 aa24.28■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 MYO7BQ6PIF6 2116 aa24.27■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 OIP5O43482 229 aa24.27■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 CYP7B1O75881 506 aa24.27■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 STSP08842 583 aa24.27■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 PCGF2P35227 344 aa24.27■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF311Q5JNZ3 666 aa24.27■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 WLSQ5T9L3 541 aa24.27■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 VASNQ6EMK4 673 aa24.27■■□□□ 1.48
CRIP1-201ENST00000330233 ARSKQ6UWY0 536 aa24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms