RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327347.9

SEPHS1-201, Transcript of selenophosphate synthetase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEPHS1, Length 3,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPHS1-201ENST00000327347 EMC8O43402 210 aa16.01■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 DNAJB6O75190 326 aa16.01■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 CLEC3AO75596 197 aa16.01■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 SERPINI2O75830 405 aa16.01■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 CFDP00746 253 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 GIFP27352 417 aa16.01■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 NOS3P29474 1203 aa16.01■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 ARHGDIBP52566 201 aa16.01■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 FAAP20Q6NZ36 180 aa16.01■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 TRILQ7L0X0 811 aa16.01■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 IL20Q9NYY1 176 aa16.01■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 DEC1Q9P2X7 70 aa16.01■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 REV3LO60673 3130 aa16.01■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 MT-ND4P03905 459 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 ASGR2P07307 311 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 MPIP34949 423 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 MAGEB1P43366 347 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 TNK1Q13470 666 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 GNA13Q14344 377 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 SERPINA12Q8IW75 414 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 OR7G2Q8NG99 324 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 OR56A1Q8NGH5 318 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 ARHGDIGQ99819 225 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 NIPAL2Q9H841 368 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 BABAM2Q9NXR7 383 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 NLGN3Q9NZ94 848 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 TRAV27A0A087WT01 109 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 PSMD9O00233 223 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 ERGP11308 486 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 FPR3P25089 353 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 ATP12AP54707 1039 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 ARHGAP19Q14CB8 494 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 WDR88Q6ZMY6 472 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF614Q8N883 585 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 OR11H7Q8NGC8 314 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 OR5W2Q8NH69 310 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 SUSD6Q92537 303 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 ISYNA1Q9NPH2 558 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 FBXO34Q9NWN3 711 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 GLTPQ9NZD2 209 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 SERGEFQ9UGK8 458 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 WDR45Q9Y484 360 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 INSL6Q9Y581 213 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 CHD9Q3L8U1 2897 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 GNB5O14775 395 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 CHP2O43745 196 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 SSNA1O43805 119 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 RGS11O94810 467 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 F3P13726 295 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 MAKP20794 623 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 OR12D2P58182 307 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 LYPD4Q6UWN0 246 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 OR4D9Q8NGE8 314 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 OR52E1Q8NGJ3 308 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 FANK1Q8TC84 345 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 GANCQ8TET4 914 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 SIPA1Q96FS4 1042 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 IFT27Q9BW83 186 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 PCBD2Q9H0N5 130 aa16■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 H3BUI4 141 aa15.99■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 SAGP10523 405 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 RAB28P51157 221 aa15.99■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 MLC1Q15049 377 aa15.99■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC48A1Q6P1K1 146 aa15.99■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 THSD4Q6ZMP0 1018 aa15.99■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa15.99■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 MRGPREQ86SM8 312 aa15.99■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 C9orf62Q8N4C0 152 aa15.99■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 ARL14Q8N4G2 192 aa15.99■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 RFLNBQ8N5W9 214 aa15.99■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 LRRC17Q8N6Y2 441 aa15.99■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 OR13C2Q8NGS9 318 aa15.99■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 GRHL3Q8TE85 626 aa15.99■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 HSD17B8Q92506 261 aa15.99■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 COX14Q96I36 57 aa15.99■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 ADAP2Q9NPF8 381 aa15.99■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 C12orf4Q9NQ89 552 aa15.99■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 MAFFQ9ULX9 164 aa15.99■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 CDK2AP1O14519 115 aa15.99■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 MID1O15344 667 aa15.99■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC6A1P30531 599 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms