RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290317.9

SLC13A3-202, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC13A3, Length 3,994 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-202ENST00000290317 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 HBQ1P09105 142 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ZP3P21754 424 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 GRK6P43250 576 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 OR4D2P58180 307 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 MVKQ03426 396 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 CD47Q08722 323 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 TNK1Q13470 666 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 RGNQ15493 299 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 FAM76BQ5HYJ3 339 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 LRIF1Q5T3J3 769 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 TIGD3Q6B0B8 471 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 TEX261Q6UWH6 196 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 KMT5CQ86Y97 462 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 PFDN5Q99471 154 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 STRADBQ9C0K7 418 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 LYRM4Q9HD34 91 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 NDUFAF4Q9P032 175 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ABCD2Q9UBJ2 740 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 MGAT4AQ9UM21 535 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 SRPK3Q9UPE1 567 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ATG4BQ9Y4P1 393 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 U3KQ87 197 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 G3V2T6 193 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 DLGAP1O14490 977 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 MYL12BO14950 172 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 NOBOXO60393 691 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 RDH16O75452 317 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 MYL12AP19105 171 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 RAB3BP20337 219 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 S100PP25815 95 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 FMO3P31513 532 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 MPLP40238 635 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ERVK-25P63136 954 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 RAE1P78406 368 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 DEFA6Q01524 100 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 TNFRSF17Q02223 184 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ID2Q02363 134 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ZIC1Q15915 447 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 REEP3Q6NUK4 255 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 SSX9Q7RTT3 188 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 RIMKLAQ8IXN7 391 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 OR4N4Q8N0Y3 316 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF614Q8N883 585 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 OR4M1Q8NGD0 313 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 NUDT8Q8WV74 236 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ASB15Q8WXK1 588 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 PEX11GQ96HA9 241 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 NPAS1Q99742 590 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 CNPPD1Q9BV87 410 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 SARGQ9BW04 601 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 KRT84Q9NSB2 600 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 HCN3Q9P1Z3 774 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 TINAGQ9UJW2 476 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 OSGIN1Q9UJX0 560 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 CHST10O43529 356 aa7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 SIGLEC6O43699 453 aa7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ORC5O43913 435 aa7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 CTSVO60911 334 aa7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 GGT1P19440 569 aa7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 KDELR2P33947 212 aa7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 TGFBR1P36897 503 aa7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 BIKQ13323 160 aa7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 AKIRIN2Q53H80 203 aa7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 CAMKMTQ7Z624 323 aa7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 GPAT4Q86UL3 456 aa7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 OR4N5Q8IXE1 308 aa7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 NUP43Q8NFH3 380 aa7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 OR9A4Q8NGU2 314 aa7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 OR6S1Q8NH40 331 aa7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 OR4C6Q8NH72 309 aa7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 PTCHD1Q96NR3 888 aa7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 CUTCQ9NTM9 273 aa7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 MCUBQ9NWR8 336 aa7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 CD300AQ9UGN4 299 aa7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 DAPP1Q9UN19 280 aa7.18□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 RNF6Q9Y252 685 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms