RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 TIMM29Q9BSF4 260 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ABRACLQ9P1F3 81 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 LHX3Q9UBR4 397 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 NR4A2P43354 598 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ALDH3B2P48448 385 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 HBA1P69905 142 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM244Q5VVB8 128 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 PAQR9Q6ZVX9 377 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SLAMF8Q9P0V8 285 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 V9GY05 133 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0A6YYH2 397 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PQ09 198 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 A6NJ64 397 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 MPIG6BO95866 241 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 P2RY2P41231 377 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF91Q05481 1191 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SLC16A9Q7RTY1 509 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 OR8J2Q8NGG1 315 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 MUL1Q969V5 352 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM68Q96MH6 324 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 C7orf72A4D263 438 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD28O15084 1053 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF852Q6ZMS4 543 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 TPRA1Q86W33 373 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 OR14K1Q8NGZ2 314 aa19.86■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 DRD1P21728 446 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 GPR50Q13585 617 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SPCS2Q15005 226 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 METTL4Q8N3J2 472 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 H0YIV9 168 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 RAB3AP20336 220 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 GABRB3P28472 473 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SLC5A2P31639 672 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SELPLGQ14242 412 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 MEF2DQ14814 521 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 PARP16Q8N5Y8 322 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 OR51T1Q8NGJ9 327 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 GAB3Q8WWW8 586 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 OR7D2Q96RA2 312 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 KCMF1Q9P0J7 381 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 RASD1Q9Y272 281 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SSTR4P31391 388 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 FASLGP48023 281 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SGPP2Q8IWX5 399 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 PRRT1Q99946 306 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 TSPAN15O95858 294 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 AHRP35869 848 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ENTPD8Q5MY95 495 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SYNPRQ8TBG9 265 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 C4orf36Q96KX1 117 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 PFDN5Q99471 154 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 MFFQ9GZY8 342 aa19.85■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 GPR39O43194 453 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 HTR3BO95264 441 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 DCNP07585 359 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 AQP2P41181 271 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 OR4N4Q8N0Y3 316 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 GPR19Q15760 415 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 TM9SF4Q92544 642 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SULT4A1Q9BR01 284 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SLC46A2Q9BY10 475 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 FTSJ1Q9UET6 329 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF337Q9Y3M9 751 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 I3L1I5 382 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 TIMP1P01033 207 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 TP53P04637 393 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ERVK-25P63136 954 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 MGAT3Q09327 533 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 GPR157Q5UAW9 335 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA0895LQ68EN5 471 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ALKAL1Q6UXT8 129 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF583Q96ND8 569 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 BTBD2Q9BX70 525 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 INIPQ9NRY2 104 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL13Q9P2N7 655 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 MYH1P12882 1939 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 BLACEA4D250 179 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINA5P05154 406 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 DLX5P56178 289 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 TSPAN31Q12999 210 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 HHLA2Q9UM44 414 aa19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB42B2RXF5 422 aa19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms