RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284483.12

TNIK-201, Transcript of TRAF2 and NCK interacting kinase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNIK, Length 4,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIK-201ENST00000284483 SVIPQ8NHG7 77 aa8.7□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 APH1BQ8WW43 257 aa8.7□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 PRAP1Q96NZ9 151 aa8.7□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 LGR4Q9BXB1 951 aa8.7□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 CST11Q9H112 138 aa8.7□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 SLC25A18Q9H1K4 315 aa8.7□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 CRYBA1P05813 215 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 EPCAMP16422 314 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 AHRP35869 848 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 CRHR2Q13324 411 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 VEZF1Q14119 521 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 SLC5A12Q1EHB4 618 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 COMMD6Q7Z4G1 85 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 NRMQ8IXM6 262 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 YAF2Q8IY57 180 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 HDDC3Q8N4P3 179 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 NANOGP1Q8N7R0 232 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 TMEM145Q8NBT3 493 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 OR2L3Q8NG85 312 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 THEM6Q8WUY1 208 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 OSTF1Q92882 214 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 UCN3Q969E3 161 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 F2RL3Q96RI0 385 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 DMRTA2Q96SC8 542 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 CRLF2Q9HC73 371 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 MED9Q9NWA0 146 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 B4GALT6Q9UBX8 382 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 USP3Q9Y6I4 520 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 CA12O43570 354 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 TSPAN6O43657 245 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 SLC16A8O95907 504 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 MAP3K8P41279 467 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 WASP42768 502 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 PRKXP51817 358 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 CLDN12P56749 244 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 TDGQ13569 410 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 FAM46CQ5VWP2 391 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 TXNDC8Q6A555 127 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 KLHL24Q6TFL4 600 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 TMEM107Q6UX40 140 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 OLIG3Q7RTU3 272 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 SERINC5Q86VE9 423 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 OR52N2Q8NGI0 321 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 ZNF563Q8TA94 476 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 CXorf40AQ8TE69 158 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 TM9SF4Q92544 642 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 HAVCR1Q96D42 359 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 SLC6A7Q99884 636 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 TRIM2Q9C040 744 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 SLC38A8A6NNN8 435 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 C1orf196B1AJZ1 125 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 MCIDASD6RGH6 385 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 PTGESO14684 152 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 TNFRSF10BO14763 440 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 CSO75390 466 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 KCNK5O95279 499 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 MAS1P04201 325 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 GIPRP48546 466 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 STK19P49842 368 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 CTSCP53634 463 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 HBA1P69905 142 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 ARFRP1Q13795 201 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 SLC8B1Q6J4K2 584 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 CMTM8Q8IZV2 173 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 OR5D16Q8NGK9 328 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 SARGQ9BW04 601 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 NT5DC2Q9H857 520 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 WDR45Q9Y484 360 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa8.69□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 OR2W5A6NFC9 320 aa8.68□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 GABRPO00591 440 aa8.68□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 CLDN4O14493 209 aa8.68□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 OR7A17O14581 309 aa8.68□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 APBB3O95704 486 aa8.68□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 GP1BAP07359 652 aa8.68□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 SHC1P29353 583 aa8.68□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 NKPD1Q17RQ9 610 aa8.68□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 MAJINQ3KP22 176 aa8.68□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 SLC22A10Q63ZE4 541 aa8.68□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 KLK6Q92876 244 aa8.68□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 FBXO17Q96EF6 278 aa8.68□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 C14orf144Q96I85 54 aa8.68□□□□□ -1.02
TNIK-201ENST00000284483 SAMD8Q96LT4 415 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms