RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 RNF170Q96K19 258 aa13.55□□□□□ -0.24
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PTPRO-201ENST00000281171 ENPP4Q9Y6X5 453 aa13.54□□□□□ -0.24
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PTPRO-201ENST00000281171 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
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PTPRO-201ENST00000281171 ISL2Q96A47 359 aa13.54□□□□□ -0.24
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PTPRO-201ENST00000281171 ZNF439Q8NDP4 499 aa13.53□□□□□ -0.24
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PTPRO-201ENST00000281171 CLEC4CQ8WTT0 213 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 HMGB4Q8WW32 186 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 WASF3Q9UPY6 502 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 SLC22A23A1A5C7 686 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 A6NIN4 97 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 CCR7P32248 378 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 LIMK1P53667 647 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 CCNJQ5T5M9 372 aa13.53□□□□□ -0.24
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