RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 NNATQ16517 81 aa16.02■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa16.02■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 MLIPQ5VWP3 458 aa16.02■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 NCOR1O75376 2440 aa16.02■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 SLC22A5O76082 557 aa16.02■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 MT-ND4P03905 459 aa16.02■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 VAMP1P23763 118 aa16.02■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 IMPA1P29218 277 aa16.02■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 DNASE1L1P49184 302 aa16.02■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 TAF13Q15543 124 aa16.02■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 S100A13Q99584 98 aa16.02■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 BABAM2Q9NXR7 383 aa16.02■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 LOC100509620A0A075B734 347 aa16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 RBM34P42696 430 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 C1orf53Q5VUE5 145 aa16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 METTL11BQ5VVY1 283 aa16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 THAP6Q8TBB0 222 aa16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 GPR34Q9UPC5 381 aa16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 PHF19Q5T6S3 580 aa16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM17Q86X19 198 aa16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 OR52E1Q8NGJ3 308 aa16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 PTTG3PQ9NZH4 202 aa16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 ADH7P40394 386 aa16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 MAP3K8P41279 467 aa16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 XCR1P46094 333 aa16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 ELP2Q6IA86 826 aa16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 ARMC10Q8N2F6 343 aa16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF248Q8NDW4 579 aa16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 OR51L1Q8NGJ5 315 aa16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM185BQ9H7F4 350 aa16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 A0A0X1KG70 313 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 MCIDASD6RGH6 385 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 DSCR3O14972 297 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 UBXN7O94888 489 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 GTF2F2P13984 249 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 ACSM3Q53FZ2 586 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 MOAP1Q96BY2 351 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 EGFP01133 1207 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 FURINP09958 794 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 DRD2P14416 443 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 PVRP15151 417 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 ETV6P41212 452 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 HES5Q5TA89 166 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 TMPRSS12Q86WS5 348 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 KLHL9Q9P2J3 617 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 ZAR1LA6NP61 321 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 POM121CA8CG34 1229 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 FZD6O60353 706 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 ITGA3P26006 1051 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 FIGLAQ6QHK4 219 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 LYPD4Q6UWN0 246 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 TDHQ8IZJ6 230 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 KIAA1958Q8N8K9 716 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 OR4K14Q8NGD5 310 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 CREB3L4Q8TEY5 395 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 SLC41A3Q96GZ6 507 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 DPH1Q9BZG8 443 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 B3GNT4Q9C0J1 378 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM38AQ9H6F2 299 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 EVA1BQ9NVM1 165 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 KCNN3Q9UGI6 736 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 PIPP12273 146 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 E2F1Q01094 437 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 LPAL2Q16609 132 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 SERPINA12Q8IW75 414 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM168Q9H0V1 697 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 CXorf36Q9H7Y0 433 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa16■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 NARSO43776 548 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 RPL35P42766 123 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 PFN3P60673 137 aa15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 TEKQ02763 1124 aa15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF227Q86WZ6 799 aa15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 GIMAP1Q8WWP7 306 aa15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 SCML1Q9UN30 329 aa15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF432O94892 652 aa15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 SPDEFO95238 335 aa15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 CTSLP07711 333 aa15.99■□□□□ 0.15
TRPC1-201ENST00000273482 TFPIP10646 304 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.1 ms